SciPy 1.7.0 发行说明#
SciPy 1.7.0 是 6 个月辛勤工作的结晶。它包含许多新功能、大量错误修复、改进的测试覆盖率和更好的文档。此版本中有许多弃用和 API 更改,如下所述。鼓励所有用户升级到此版本,因为它包含大量错误修复和优化。在升级之前,我们建议用户检查自己的代码是否使用了已弃用的 SciPy 功能(为此,请使用 python -Wd
运行代码并检查 DeprecationWarning
s)。我们的开发注意力现在将转移到 1.7.x 分支上的错误修复版本,以及在主分支上添加新功能。
此版本需要 Python 3.7+ 和 NumPy 1.16.5 或更高版本。
对于在 PyPy 上运行,需要 PyPy3 6.0+。
此版本亮点#
添加了一个新的准蒙特卡洛子模块,
scipy.stats.qmc
文档设计已更新为使用与 NumPy 和其他生态系统库相同的 PyData-Sphinx 主题。
我们现在提供并利用 Boost C++ 库,以实现对
scipy.stats
中长期存在的弱点的许多改进scipy.stats
有六个新分布、八个新的(或经过改进的)假设检验、一个用于引导的新函数、一个可以快速进行随机变量采样和百分位数函数评估的类以及许多其他增强功能。由于重写为新的 C++ 后端框架,对于多种指标,特别是加权情况,
cdist
和pdist
距离计算速度更快添加了一个新的径向基函数插值类 RBFInterpolator,以解决 Rbf 类的问题。
我们衷心感谢 Chan-Zuckerberg Initiative Essential Open Source Software for Science 项目对 scipy.stats
的许多改进提供的支持。
新功能#
scipy.cluster
改进#
已将可选参数 seed
添加到 kmeans
和 kmeans2
,以设置随机生成器和随机状态。
scipy.interpolate
改进#
改进了 fitpack.bispev
和 fitpack.parder
的输入验证和错误消息,用于以前给用户造成重大困惑的场景。
新增了 RBFInterpolator 类来取代 Rbf 类。新类的用法更贴近其他插值器类,纠正了导致意外平滑行为的符号错误,在插值中包含了多项式项(这对某些 RBF 选择是必要的),并且支持仅使用 k 最近邻进行插值以提高内存效率。
scipy.linalg
改进#
添加了 LAPACK 包装器以访问 tgexc
子例程。
scipy.ndimage
改进#
scipy.ndimage.affine_transform
现在可以从 out
数组推断 output_shape
。
scipy.optimize
改进#
可选参数 bounds
已添加到 _minimize_neldermead
,以支持 Nelder-Mead 求解器的边界约束。
trustregion
方法 trust-krylov
、dogleg
和 trust-ncg
现在可以使用 ["2-point", "3-point", "cs"]
中的一种通过有限差分来估计 hess
。
halton
作为 scipy.optimize.shgo
中的 sampling_method
被添加进来。sobol
已修复,现在使用 scipy.stats.qmc.Sobol
。
halton
和 sobol
作为 scipy.optimize.differential_evolution. 中的 init
方法被添加进来。
differential_evolution
现在接受一个 x0
参数,为最小化提供一个初始猜测。
当启用 Pythran 转译器构建 SciPy 时,least_squares
的性能有适度提升。
当 linprog
与 method
'highs'
、'highs-ipm'
或 'highs-ds'
一起使用时,结果对象现在报告与每个约束相关的边际值(也称为影子价格、对偶值)和残差。
scipy.signal
改进#
get_window
支持 general_cosine
和 general_hamming
窗函数。
scipy.signal.medfilt2d
现在在适当的地方释放 GIL,以通过多线程计算提高性能。
scipy.sparse
改进#
现在 dia_matrix
稀疏矩阵的加法运算速度更快。
scipy.spatial
改进#
distance.cdist
和 distance.pdist
对于某些加权度量标准的性能有了很大的提高。 即:minkowski
、euclidean
、chebyshev
、canberra
和 cityblock
。
上述许多未加权的 cdist
和 pdist
度量标准的性能有适度提升。
参数 seed
已添加到 scipy.spatial.vq.kmeans 和 scipy.spatial.vq.kmeans2。
参数 axis
和 keepdims
已添加到 scipy.spatial.distance.jensenshannon
。
rotation
方法 from_rotvec
和 as_rotvec
现在接受一个 degrees
参数来指定使用角度而不是弧度。
scipy.special
改进#
对于正参数,Wright 广义贝塞尔函数已添加为 scipy.special.wright_bessel
。
现在可以通过 scipy.special.ndtri_exp
使用正态分布的对数 CDF 的逆实现。
scipy.stats
改进#
假设检验#
Mann-Whitney-Wilcoxon 检验 mannwhitneyu
已重写。它现在支持 n 维输入、没有关联时的精确检验方法以及改进的文档。有关默认行为的调整,请参阅“其他更改”。
新函数 scipy.stats.binomtest
取代了 scipy.stats.binom_test。新函数返回一个对象,该对象计算比例参数的置信区间。此外,通过使用二分查找,性能从 O(n) 提高到 O(log(n))。
Cramer-von Mises 检验的双样本版本在 scipy.stats.cramervonmises_2samp
中实现。
Alexander-Govern 检验在新函数 scipy.stats.alexandergovern
中实现。
新函数 scipy.stats.barnard_exact
和 scipy.stats.boschloo_exact 分别执行 2x2 列联表的 Barnard 精确检验和 Boschloo 精确检验。
新函数 scipy.stats.page_trend_test
执行用于有序替代项的 Page 检验。
新函数 scipy.stats.somersd
执行 Somers' D 检验,用于衡量两个变量之间的序数关联。
在 scipy.stats.ttest_ind
中添加了一个选项 permutations
,用于执行置换 t 检验。还添加了一个 trim
选项来执行截断(Yuen's)t 检验。
将 alternative
参数添加到 skewtest
、kurtosistest
、ranksums
、mood
、ansari
、linregress
和 spearmanr
函数,以允许单边假设检验。
样本统计#
新函数 scipy.stats.differential_entropy
从样本估计连续分布的微分熵。
boxcox
和 boxcox_normmax
现在允许用户控制用于最小化负对数似然函数的优化器。
新函数 scipy.stats.contingency.relative_risk
计算 2x2 列联表的相对风险或风险比。返回的对象有一个计算相对风险置信区间的方法。
通过移除重复/冗余计算,提高了 skew
和 kurtosis
函数的性能。
scipy.stats.mstats.hdquantiles_sd
的性能得到显著提升。
新的函数 scipy.stats.contingency.association
计算列联表的几个关联度量:皮尔逊列联系数、克莱姆V系数和楚普罗夫T系数。
参数 nan_policy
被添加到 scipy.stats.zmap
中,以提供处理输入数据中 nan
出现情况的选项。
参数 ddof
被添加到 scipy.stats.variation
和 scipy.stats.mstats.variation
中。
参数 weights
被添加到 scipy.stats.gmean
中。
统计分布#
我们现在供应商化并利用 Boost C++ 库来解决之前在 stats
中报告的许多问题。值得注意的是,beta
、binom
、nbinom
现在具有 Boost 后端,并且可以轻松利用后端进行其他函数的操作。
偏斜柯西概率分布已实现为 scipy.stats.skewcauchy
。
齐普夫概率分布已实现为 scipy.stats.zipfian
。
新的分布 nchypergeom_fisher
和 nchypergeom_wallenius
分别实现了非中心超几何分布的 Fisher 和 Wallenius 版本。
广义双曲分布已在 scipy.stats.genhyperbolic
中添加。
学生化极差分布已在 scipy.stats.studentized_range
中添加。
scipy.stats.argus
现在改进了对小参数值的处理。
更好的参数处理/准备工作导致许多分布的性能提升。
cosine
分布为 ppf
、cdf
、sf
和 isf
方法添加了 ufuncs,包括在分布支持的边缘处的数值精度改进。
通过矩量法将分布拟合到数据的选项已添加到单变量连续分布的 fit
方法中。
其他#
scipy.stats.bootstrap
已被添加,以允许估计统计量的置信区间和标准误差。
新的函数 scipy.stats.contingency.crosstab
计算给定数据的列联表(即,唯一条目的计数表)。
scipy.stats.NumericalInverseHermite
能够对任意单变量统计分布进行快速随机变量抽样和百分位数函数评估。
新的scipy.stats.qmc
模块#
这个新模块提供了准蒙特卡罗 (QMC) 生成器和相关的辅助函数。
它提供了一个通用类 scipy.stats.qmc.QMCEngine
,它定义了一个 QMC 引擎/采样器。引擎是状态感知的:它可以被继续、推进和重置。提供了 3 个基本采样器
scipy.stats.qmc.Sobol
是著名的 Sobol 低差异序列。添加了一些警告来引导用户正确使用此采样器。默认情况下,序列是被扰乱的。scipy.stats.qmc.Halton
:Halton 低差异序列。默认情况下,序列是被扰乱的。scipy.stats.qmc.LatinHypercube
:简单的 LHS 设计。
并且提供了 2 个特殊的采样器
scipy.stats.qmc.MultinomialQMC
:使用任何基本scipy.stats.qmc.QMCEngine
从多项分布中采样。scipy.stats.qmc.MultivariateNormalQMC
:使用任何基本scipy.stats.qmc.QMCEngine
从多元正态分布中采样。
该模块还提供以下帮助程序
scipy.stats.qmc.discrepancy
:根据空间覆盖率评估一组点的质量。scipy.stats.qmc.update_discrepancy
:可以在优化循环中使用以构造一组好的点。scipy.stats.qmc.scale
:轻松地将一组点从(到)单位区间缩放到(从)给定的范围。
已弃用的功能#
scipy.linalg
弃用#
scipy.linalg.pinv2 已被弃用,其功能已完全并入
scipy.linalg.pinv
。scipy.linalg.pinv
和scipy.linalg.pinvh
的rcond
、cond
关键字均无法正常工作,现在已被弃用。它们现在被功能正常的atol
和rtol
关键字替换,并具有明确的用法。
scipy.spatial
弃用#
scipy.spatial.distance
度量标准期望 1 维输入向量,但会在其输入上调用np.squeeze
以接受任何额外的长度为 1 的维度。该行为现在已被弃用。
向后不兼容的更改#
其他更改#
我们现在接受并利用来自提前将 Python 转换为 C++ 的转译器 Pythran 的性能改进,该转译器可以选择禁用(通过 export SCIPY_USE_PYTHRAN=0
),但在构建时默认启用。
scipy.stats.mannwhitenyu 的默认行为有两个更改
多年来,使用默认的
alternative=None
已被弃用;必须明确指定alternative
。现在允许使用新的默认值alternative
,即“双侧”。以前,所有 p 值都基于渐近近似。现在,对于没有联系的小样本,默认情况下返回的 p 值是精确的。
已添加对 PEP 621 ( pyproject.toml
中的项目元数据) 的支持。
我们现在支持 Gitpod 环境,以降低 SciPy 开发的入门门槛;有关更多详细信息,请参阅 quickstart-gitpod
。
针对 1.7.0 关闭的问题#
#636: 统计审查: mannwhitneyu (Trac #109)
#1346: signal.medfilt2d 应回退到 signal.medfilt 以处理类型…
#2118: Mann-Whitney 统计量返回不正确的结果 (Trac #1593)
#2158: special.chndtrix (ncx2.ppf) 给出错误结果 (Trac #1633)
#3284: build_sphinx 的怪异之处
#3352: beta 分布 sf
#4067: 包含 nan 的数组的 Mannwhitneyu 仍然报告显著性
#4080: Scipy 中的熵
#4641: mstats.mannwhitneyu 和 stats.mannwhitneyu 返回不一致…
#5122: scipy.stats.binom.ppf 在 p=0 时不正确
#5180: Rbf 插值 - 仅使用 K 个最近邻
#5258: 当输出数组时,affine_transform 抱怨 output_shape…
#5562: Wishart 自由度应为 $v > p-1$ 而不是 $v…
#5933: mstats_basic.py - mannwhitneyu [scipy/scipy/stats/mstats_basic.py]
#6409: _unequal_var_ttest_denom 在早期样本中导致 ZeroDivisionError
#6682: 负二项生存函数不精确
#6897: 空集的 scipy.stats.mannwhitneyu 给出 p=0.0 且不…
#7303: stats.describe 与 nan_policy=omit 返回矩阵范围的 minmax…
#7406: 如果 n…,则 scipy.stats.binom.ppf 对于 0 和 1 之间的 q 返回 nan
#7437: ENH: 将偏斜柯西分布添加到 stats
#7542: DOC: stats 教程: 关于反正弦和学生 t 公式的问题
#7593: `scipy.optimize.minimize` 中 `tol` 参数的含义是…
#8565: SmoothSphereBivariateSpline() 中的错误: “ValueError: 错误代码…”
#8665: `scipy.ncx2.sf` 应单调递减
#8836: scipy.optimize.linprog(method='simplex') 需要返回对偶
#9184: Mann-Whitney 实现是否错误?
#9450: 允许在 vq.kmeans2 中播种 init 方法
#9704: RectSphereBivariateSpline 对于负经度失败
#9836: 当 s 与…相比非常低时,scipy.stats.rice 给出不正确的结果
#9904: 请求/提议: 大大改进 scipy.interpolate.Rbf
#9981: stats.kruskal : 为包含 2 个或更多列的输入添加警告
#10358: DOC: 需要 linprog 和 linear_sum_assignment 教程
#10908: Nakami 拟合不收敛 (scipy.stats)
#10933: 添加缩放的逆卡方分布
#11014: 用于更强大的 2x2 列联表假设检验的巴纳德检验…
#11050: 功能请求: 带有边界的 Nelder-Mead
#11086: scipy.stats.skew 对于浮点数无法正确工作
#11113: 当使用…时,ttest_ind 和 mannwhitneyu 返回不一致的结果
#11134: p=0 时二项分布的置信区间错误
#11325: 为 scipy.spatial.distance.jensenshannon 添加 axis 参数
#11474: 对于较大的 mu1 = mu2,scipy.stats.skellam.cdf(0) 返回 0
#11523: scipy.stats.zipf 未实现 zipf 分布
#11848: 如何从“linprog”优化中获取拉格朗日/lambda 乘数…
#11909: 在 boxcox 中启用 lambda 的边界
#12118: 文档字符串缺少默认值
#12132: 要修剪或移动到 test('full') 的慢速测试
#12230: 树状图: 当使用…时,启用带有“labels”的叶子标签
#12282: scipy.stats.chisquare 测试未检查观察值和期望值是否…
#12298: BUG: fmin_powell 在 1.5.0rc 中缺少 squeeze
#12403: 将 nan_policy 添加到 stats.zmap
#12518: Kolmogorov Smirnov 检验的零假设描述不正确
#12534: 功能请求:scipy.linalg.norm 处理 0 大小的数组
#12622: scipy.interpolate.interpn 文档字符串示例
#12635: scipy.stats.beta.ppf 给出意外结果
#12669: 复杂 CSD 的中值平均
#12731: stats.ncx2.cdf 在 nc >> x >> 1 时失败
#12778: scipy.stats.weightedtau 的文档令人困惑
#12794: [错误] stats.beta.isf 的结果与 stats.beta.sf 不一致
#12837: stats.mannwhitneyu 可以支持数组
#12868: `interp2d` 中的向量值插值
#12922: 使用 trust-constr 方法进行最小化,如果选项… 则导致 TypeError
#12929: 使用星号表达式创建数据会分散对理解的注意力…
#12965: scipy.interpolate.RectSphereBivariateSpline(u,… 参数的域
#13025: 广义双曲分布
#13090: signal.max_len_seq 的文档中的链接损坏
#13101: MAINT: 升级 docker 文件中的 python 版本
#13158: `signal.get_window()` 缺少文档链接,无法获取…
#13173: 来自 bisplev 函数的无信息错误消息
#13234: BUG: stats: 当…时,burr.moment() 和 fisk.moment() 的形状错误
#13242: kmeans 会“丢弃”聚类吗?
#13243: tgsen 使用输出参数来计算默认参数
#13245: 对于相同元素的数组,峰度返回 1
#13257: MacOS 的 GitHub Actions 测试失败
#13272: scipy.stats.yeojohnson_llf 文档错误
#13280: hypergeom cdf 结果错误
#13285: scipy.stats.t 中的描述更正
#13287: 使用 mu 而不是 prob 生成二项式 CDF
#13294: BUG: stats: 分布的 ‘support’ 方法返回错误的边界…
#13299: scipy.spatial 的类型提示
#13300: 向拉丁超立方初始种群添加单个个体…
#13311: MAINT: pavement.py PYVER 已过时
#13339: 如果任何维度为零,savemat 会丢弃维度信息
#13341: 添加带有 ddof 参数的 scipy.stats.variation
#13353: 文档:在 scipy.stats.johnsonsu 中,参数 `a` 可以…
#13405: TST:为稀疏 BSR ctor 添加一些测试
#13410: BUG:空数组的偏度引发错误
#13417: 从余弦生成随机数的速度提高 10,000 倍…
#13440: python runtest.py -t path-to-test.py 失败
#13454: Scipy 余弦距离可能大于 2
#13459: cramervonmises 文档中的链接损坏
#13494: optimize.linprog_simplex 文档中的一个单词拼写错误
#13501: 使用 Powell 方法和 Bounds 进行最小化导致 “TypeError:…”
#13509: signal.medfilt2d 与 ndimage.median_filter
#13511: DOC: “fmin_powell” 的 “direc” 参数描述中的错误
#13526: TST: stats: 间歇性 `test_ttest_ind_randperm_alternative2…`
#13536: `_within_tolerance` 似乎是不必要的 `numpy.isclose` 重复
#13540: scipy-wheels-nightly 上缺少 python 3.8 manylinux wheels
#13559: 使用修订的单纯形法的 linprog 中的形状错误
#13587: 使用单精度时,binned_statistic 不可靠
#13589: 统计包中分布的更好参数准备。
#13602: 晶体球分布的熵有时为负无穷大
#13606: MAINT: mypy: 运行 mypy 时出现一些类型错误 + 添加 mypy…
#13608: 为什么 stats.binned_statistic_2d 会转换其 values 参数…
#13609: BUG: SciPy pip install -e 得到无法使用的版本规范
#13610: Highs 求解器未提供解决方案,也未报告失败
#13614: BUG: invgauss.cdf 在 `mu`… 时应返回正确的值
#13628: scipy.special.spence 函数定义中的 1 个字母拼写错误…
#13634: mmwrite 在密集的斜对称数组上失败
#13646: Windows 10 上稀疏矩阵 argmax() 整数溢出
#13647: `scipy.stats.qmc.LatinHypercube` 无法采样单个样本…
#13651: scipy.linalg.eigvalsh 中的文档错误
#13664: BUG: 伽马分布的反生存函数溢出…
#13693: BUG: sokalmichener 似乎错误地应用了权重
#13697: BUG: stats: arcsine.pdf 在…处生成伪造警告
#13704: 使传递相对于…的秩截止值成为可能
#13707: Kullback Leibler 散度广播不再起作用
#13740: Scipy.optimize x0 在边界内时超出边界。
#13744: scipy.interpolate.interp1d 对于非唯一…具有不一致的行为
#13754: optimize.minimize ‘trust’ 方法和有限差分 Hessian…
#13762: MAINT, TST: aarch64 stats 测试失败在 wheels 中显示…
#13769: probplot 即使在 fit=False 时也绘制拟合线
#13791: BUG: stats: wrapcauchy.cdf 不会广播形状参数…
#13793: CI:CircleCI 文档构建失败
#13840: 由于 `special/_cosine.c` 中使用了 C99,导致 manylinux1 构建失败
#13850: CI:由于 bintray,Homebrew 失败
#13875: BUG: 使用 Yates 校正的 chi2_contingency
#13878: BUG: `signal.get_window` 参数处理问题
#13880: 删除所有 numpy.compat 的用法
#13896: Boschloo 检验,用于更强大地检验 2x2 列联表…
#13923: 正态分布的对数 CDF 的逆
#13933: `signal.get_window` 不支持 `general_cosine` 和…
#13950: DOC: scipy.spatial.KDTree.query
#13969: N=4 不得超过 M=3
#13970: 可以引用 Pearson 关于卡方检验的原始论文。
#13984: 更快地添加稀疏对角矩阵
#13988: 使用 scipy 1.6 版本的 scipy.io.wavfile 时发生错误…
#13997: BUG: sparse: 来自 `dia_matrix.diagonal()` 的结果不正确
#14005: MAINT: optimize: 可以改进 `curve_fit` 输入错误消息。
#14038: MAINT: 为 _sobol.pyx 添加类型注释
#14048: DOC:缺少 git 子模块信息
#14055: linalg.solve:当使用 assume_a='her' 且输入为实数时,错误提示不明确
#14093: 文档:`...`中默认值的定义不一致
#14158: 测试,错误:test_rbfinterp.py – test_interpolation_misfit_1d 测试失败
#14170: 测试:signal 子模块 test_filtfilt_gust 在 32 位 amd64 架构上失败
#14194: 维护:download-wheels.py 缺少导入
#14199: 1.7.0rc1 中 biasedurn 扩展的生成源代码已损坏
1.7.0 的拉取请求#
#4824: 置换 T 检验 (新的 PR)
#4933: ENH:更新 Mann-Whitney-Wilcoxon 检验
#7702: ENH:stats:添加偏斜柯西分布
#8306: scipy.signal.max_len_seq_inner 的可选 Pythran 支持
#10170: 维护:stats:将余弦分布的 cdf 和 ppf 实现为 ufunc
#10454: ENH:扩展 find_peaks_cwt 以接受数字和可迭代对象作为...
#10844: ENH:添加具有准蒙特卡罗功能的 stats.qmc 模块
#11313: ENH:添加 Wright 广义贝塞尔函数
#11352: ENH:stats:添加交叉表函数。
#11477: FIX:cdfchn.f 中的有界参数产生错误结果
#11695: ENH:stats:将矩量法添加到 `rv_continuous.fit`
#11911: ENH:为 boxcox 和 boxcox_normmax 添加边界
#12438: 错误:在椭圆滤波器设计中使用 ellipkm1 以防止数值...
#12531: ENH:stats:添加 Page 的 L 检验
#12603: ENH:stats:添加 `binomtest` 以替换 `binom_test`。
#12653: ENH:stats:添加 Somers' D 检验
#12676: 错误:更新 signal.csd 中的中值平均
#12760: 错误:special:erfinv(x<<1) 损失精度
#12801: ENH:将单侧 p 值添加到剩余的 spearmanr 和 linregress
#12873: ENH:Stats:添加 Alexander Govern 检验
#13008: ENH:为使用正态 CDF 进行 p 值计算的函数添加“alternative”
#13040: 错误:允许 RectSphereBivariateSpline 接受负经度
#13048: ENH:stats:添加计算相对风险的函数。
#13067: ENH:为 stats.gmean 添加 weights 参数
#13084: ENH:快速汉克尔变换
#13104: 维护:升级 python 版本 (为 docker 开发环境删除 python 3.6)
#13153: ENH:添加关联度量 Pearson 列联系数...
#13166: ENH:stats:为 zmap 添加 nan_policy。
#13175: 维护:`linear_sum_assignment` 中高成本矩阵的测试
#13177: 错误:当 ndim ... 时在 fourier_ellipsoid 中引发 NotImplementedError
#13184: 错误:stats:修复 mstats.describe 使用 ... 的最小值和最大值计算
#13188: 文档:stats:使 kstest 的零假设和备择假设更...
#13193: 维护:stats:卡方检验观察/预期频率的总和
#13197: ENH/维护:HiGHS 上游增强和错误修复
#13198: ENH:允许在 affine_transform 中从 out 数组推断 output_shape
#13204: ENH:stats:添加齐普夫分布(不同于齐普夫/泽塔分布)
#13208: REL:将版本设置为 1.7.0.dev0
#13216: 测试:stats:分解并标记缓慢测试
#13224: 更新加权 τ 的文档
#13230: ENH:linalg:为 tgexc 添加 LAPACK 封装。
#13232: 维护:stats:当 kruskal 的输入 >1 维时引发错误
#13233: 文档:stats:修复教程中反正弦的 MGF 和 t 的熵
#13236: 维护:重新组织共享线性分配测试
#13237: 基准测试:重构 stats.Distribution 以轻松添加新分布
#13238: 错误:stats:修复 burr 和 fisk 分布的错误形状输出
#13240: 维护:为线性求和分配添加微不足道的成本矩阵的测试
#13252: 文档:优化:添加 `optimize.linear_sum_assignment` 教程。
#13254: 错误:修复偏度和峰度中常数输入的精度问题
#13262: 错误:scipy.medfilt 和 .medfilt2d 修复
#13263: ENH:为两个样本添加 Cramer-von Mises 检验
#13264: 修复 `stats.anderson` 文档中的一个小错别字
#13268: ENH:stats:为 t 分布添加 _entropy 的实现。
#13273: 文档:stats:修复 Yeo-Johnson LL 函数文档中的错别字
#13275: 维护:stats:更正 gamma 的 _fitstart 方法中的注释。
#13283: 错误:stats:修复 rv_discrete 类的 cdf 方法
#13286: 文档:stats:澄清 rv_continuous/discrete.stats 示例
#13288: 文档:stats:离散分布形状参数限制
#13289: 维护:修复 sigtoolsmodule.c 中的构建警告
#13290: 文档:扩展 nan_policy API 的讨论。
#13291: 维护:signal,stats:在适当的地方使用 keepdims。
#13292: 文档:stats:注意 nbinom 的另一种常见参数化
#13293: 文档:将默认值的损坏链接更改为存档链接
#13295: 错误:stats:修复支持方法以返回正确的边界
#13296: 文档:stats:修复 kstwo 文档字符串中的 latex 标记。
#13297: 测试:将 kde.logpdf 溢出测试标记为 xslow
#13298: 广义双曲分布
#13301: 文档:cluster:在 cluster.vq.kmeans 的文档字符串中添加聚类编号注释
#13302: 错误:修复 ndimage.morphology.distance_transform_* 参数处理
#13303: CI:防止 Codecov 给出错误的 CI 失败和错误的 PR 注释
#13313: ENH:qhull 的静态类型
#13316: scipy.signal._spectral 的 Pythran 实现
#13317: 文档:向前移植 1.6.0 relnotes
#13319: ENH:stats:添加分布 CDF 的快速数值反演
#13320: ENH:differential_evolution 的 x0
#13324: 文档:将 linprog highs versionadded 更正为 1.6
#13326: 维护:将 numpydoc 更新到 v1.1.0
#13327: 文档:interpolate:改进了 `interpolate.interpn()` 的文档字符串示例...
#13328: ENH:Boost 统计分布
#13330: ENH:stats:添加非中心超几何分布(Fisher 的...
#13331: 维护/ENH:解决 mypy 警告/错误
#13332: 文档:interpolate:改进了 `interpolate.interp2d` 的文档字符串...
#13333: ENH:stats:更多 _sf 和 _isf 实现。
#13334: 维护:stats:清理 _continuous_distns.py 中的一些已失效的注释
#13336: scipy.optimize._group_columns 的 Pythran 版本
#13337: 文档|ENH:scipy.integrate.simpson 中的类型提示
#13346: ENH:stats:为“variation”函数添加“ddof”参数
#13355: ENH:stats:为 loggamma 实现 _logpdf,_sf 和 _isf。
#13360: ENH|文档:修复 interpolate.RectSphereBivariateSpline 中的文档字符串和输入验证
#13366: 错误:stats:不要在 _unequal_var_ttest_denom 中引发 ZeroDivisionError
#13370: ENH: 修复 stats 中小参数的 ARGUS 分布
#13371: ENH: stats: 添加 `bootstrap` 用于估计置信区间…
#13373: BUG: io/matlab: 保留空 >=2D 数组的维度
#13374: ENH: stats: 添加偏斜柯西分布
#13379: BUG: sparse: 修复稀疏 lsqr 中的冗长输出
#13383: TST: stats: 标记多维排列 t 检验为慢速
#13384: MAINT: 使关键字数组为静态
#13388: PERF: 避免在偏度和峰度中重复计算均值
#13389: DOC: 修复已弃用的指令语法
#13390: DOC: 更正参数部分下划线的行长
#13393: MAINT: stats: 允许 wishart 维度 - 1 < df < 维度
#13395: DOC: 修复 setup.py 警告消息中的错别字
#13396: BUG: 修复 Nakagami 的 MLE `nakagami_gen.fit`
#13397: MAINT:linalg: 修复 tgsen 系列包装器和 ordqz
#13406: TST: 为稀疏 BSR 构造函数添加错误处理测试
#13413: DOC: 超快速入门指南
#13418: BUG: 修复矩返回不一致的类型和形状
#13423: DOC: 更新 leaf_label_func/dendrogram 的示例
#13431: ENH: stats: 为 nhypergeom 覆盖 _rvs
#13432: 在 NDInterpolator 文档字符串中添加指示符,说明 N 必须 > 1
#13434: DOC: stats: 注意缩放逆卡方分布和逆伽马分布之间的关系
#13436: ENH: interpolate: 添加输入验证来检查输入 x-y 是否…
#13441: ENH: 添加 `barnard_exact` 测试到 scipy.stats。
#13443: MAINT: stats: skewcauchy 的更新
#13444: DOC: 澄清 johnsonsu/johnsonsb 的 `a` 参数范围
#13445: DOC: 修复 runtests 指南。
#13446: MAINT: stats: 向 wrapcauchy 添加 _fitstart 方法。
#13447: DEV: 更新开发 Docker 镜像
#13448: ENH: 为 `scipy.spatial.distance` 添加注释
#13451: DOC: 轻微的格式化。
#13458: DOC: 缩进另请参阅。
#13460: DOC: stats: 修复指向 Cramer-von Mises 维基百科文章的链接。
#13461: DOC: 重组 scipy.stats 概述文档页面
#13463: DOC: 杂项格式修复
#13466: DOC: 另请参阅中的错别字 s/SmoothUni/SmoothBi/g
#13467: DOC: optimize: 添加关于 `minimize` 的 `tol` 参数的描述。
#13469: MAINT: 重构优化方法以使用 scipy.stats.qmc
#13477: CI: 将 numpy 固定到 1.19.5 以用于三个 macOS CI 作业
#13478: DOC: 修复 Sphinx 指令中缺少双 :: 的错别字
#13481: CI: 在 Azure 上的 4 个并行 Windows 构建中将 numpy 固定到 1.19.5
#13482: CI: 在 macOS CI 中再次使用 numpy 1.20.0
#13483: DOC: 多处文档语法修复。
#13484: 将一些 pythran 配置从 CI 移动到 setup
#13487: DOC: 添加关于 scipy.stats.qmc 的教程
#13492: ENH: GH 操作不应在 fork 上运行
#13493: DEV: 为 SciPy 启用 gitpod
#13495: DOC: optimize.linprog_simplex 文档中的一个词错别字
#13499: DOC: 描述 LSAP 实现
#13502: BUG: 使用列表创建的边界不适用于 Powell
#13507: MAINT, TST: stats: 集中化所有无效参数列表…
#13510: DOC: stats: 修复 ‘multivariate_hypergeom’ 中的小型文档错误
#13513: DOC: 在 ltisys.py 的示例中添加了数学符号
#13514: ENH: 简化 Sobol 的 low_0_bit 函数
#13515: ENH: optimize: 为 nelder-mead 求解器添加边界约束支持
#13516: DOC: 减少 johnsonb 文档字符串中的 LaTeX 使用
#13519: BLD: 从 setup.py 中删除 build_sphinx 支持
#13527: TST: stats: 在 32 位上 xfail ttest_ind_randperm_alternative2
#13530: DOC: 更正中值滤波器函数之间的比较
#13532: ENH: 在 medfilt2d 中释放 GIL
#13538: DOC: optimize: 修复 ‘fmin_powell’ 中的小型文档错误 (#13511)
#13546: DOC: 修复 ndimage 的 “mode” 选项列表
#13549: ENH: stats: 向一些正态性测试添加 ‘alternative’ 关键字。
#13551: MAINT: 将 git 添加到 docker env
#13552: MAINT: stats: 删除 float_power 垫片
#13553: DOC: 在 stats 教程中使用 support 而不是 a/b
#13560: MAINT: optimize: 改进稀疏输入 linprog 的错误消息…
#13562: MAINT: optimize: 使用 np.isclose 而不是 _within_tolerance。
#13566: ENH: 加速 hdquantiles_sd()
#13569: BENCH: optimize: 仅基准测试 HiGHS 方法;添加更大的 linprog…
#13574: DOC: 在 cluster.hierarchy.dendrogram ‘level’ 参数的描述中,…
#13576: ENH: 提高差异性能
#13579: TST: 将 pybind11 添加到 tox 环境
#13583: BUG: 修复 Dockerfile apt-get 安装
#13588: MAINT: 前向移植 1.6.1 发行说明。
#13593: BUG: stats: 为 bin 边缘保留样本 dtype
#13595: ENH: interpolate: 添加 RBFInterpolator
#13596: DOC: 修复 new_stats_distribution.rst.inc 中的缩进
#13601: 为 get_window 函数添加 dpss
#13604: DOC: 更正对偶退火访问参数范围。
#13605: 将 Codecov 徽章添加到 README
#13607: MAINT: stats: 修复 crystalball 熵
#13611: 更好地准备 stats 包中分布的参数。
#13612: 为 Windows cmd 添加 docker run 命令
#13613: MAINT, CI: mypy: 修复类型错误 + 将 mypy 添加到 CI
#13616: FIX: 当 mu 非常小时,为 invgauss.cdf 返回正确输出
#13617: MAINT: 接受 find_peaks_cwt 中宽度的数字和可迭代对象
#13620: CI: 禁用 mypy CI 作业(部分还原 gh-13613)
#13621: DOC: signal: 为输入类型使用 array_like
#13622: MAINT: 清理一些未使用的文件,使 `mypy scipy` 通过
#13623: CI: 再次启用 Mypy CI 作业
#13624: TST: 为 `dual_annealing` 的 `visiting_param` 输入测试更多值
#13625: 在文档中将 integrate.simps 重命名为 integrate.simpsons…
#13631: ENH: 添加 `stats.differential_entropy` 函数
#13633: BUG: stats.binned_statistic_2d 用户函数期望数组
#13641: ENH: 为 rotvec 添加了 degrees 参数
#13645: MAINT: mypy: 不安装 numpy-stubs
#13649: BUG: sparse: csc_matrix.argmax() 整数溢出
#13650: ENH: stats: 向 ansari 添加 ‘alternative’ 参数
#13652: DOC: 修复 eigvalsh 文档 (#13651)
#13654: BUG: 修复拉丁超立方体
#13656: DOC: 修复 PCHIP 引用
#13657: TST: 删除调试会话中的 IPython 警告
#13658: 删除文档字符串中多余的引号
#13661: ENH: stats: 提高精确排列的效率/修复错误…
#13667: MAINT: 将最新的 Docker 镜像设置为默认
#13668: MAINT: 将 .theia/ 添加到 .gitignore
#13669: BLD: 将 SCIPY_USE_PYTHRAN 默认值更改为 `1`
#13676: ENH: 对带阻尼的 LSQR 进行小改进
#13678: MAINT: 将 Pythran 生成的文件添加到 .gitignore
#13679: MAINT: 将 `conda develop .` 移动到 Gitpod 配置中
#13680: DOC: 添加 cKDTree 与 KDTree 的比较说明
#13681: DOC: 构建关于 Pythran、编译代码和清理的文档更新
#13683: BUG: mmwrite 正确序列化非斜对称数组
#13684: FIX: 修复 gamma.isf 方法中的数值溢出
#13685: BUG: 修复余弦距离范围为 0-2
#13694: MAINT: 修复 NumPy 版本不正确时发出的警告
#13696: ENH: 在 ttest_ind 中支持修剪
#13698: BUG: stats: 修复 arcsine.pdf 生成的虚假警告
#13701: DEV: scipy.interpolate b样条(周期情况)
#13702: DEP: 清理 spatial.distance 中已过期的弃用
#13703: MAINT: 修复静态代码分析发现的问题
#13706: ENH: stats: 实现拉普拉斯分布的 sf 和 isf
#13711: MAINT: stats: 修复 scipy.stats.entropy 的广播
#13712: BUG: stats: 覆盖 invweibull 分布的 _fitstart
#13713: DOC: 更新 toolchain.rst 以反映 Windows 通用 C 运行时
#13714: MAINT: stats: 从 test_continuous_basic.py 中删除未使用的列表
#13715: MAINT: stats: 无需抑制 frechet 弃用警告
#13716: MAINT: 按照 PEP 3135 的描述使用 super()
#13718: MAINT: 新式类,删除对 object 的继承
#13721: MAINT: 为 mpmath 添加类型忽略 (#13721)
#13723: MAINT: mypy: 在 mypy.ini 中忽略 mpmath 导入
#13724: DOC: pydata sphinx 主题
#13725: BENCH: 为 Kendalltau 添加基准测试
#13727: CI: 简化 Azure 的 Pythran 配置设置
#13731: MAINT: stats: 一些 flake8 驱动的清理
#13732: ENH: stats: 学生化极差分布
#13735: DOC: 更正 Voronoi 文档字符串
#13738: DOC: 为 wright_bessel 添加示例
#13739: ENH: stats: 为 chi 分布实现 _sf 和 _isf
#13741: MAINT: 防止在 minimize 中覆盖 x
#13747: DOC: 为非唯一 x 值的 interp1d 添加说明
#13749: MAINT: 向前移植 1.6.2 relnotes
#13759: MAINT: simpson 小的性能加速
#13765: FIX: 缺少 npymath 导致 npy_log1p 未知
#13768: BENCH: 添加缺少的 pythran 依赖项
#13770: ENH: stats.contingency: 将稀疏选项添加到 crosstab
#13774: DEP: 弃用 spatial.distance 中对输入向量的挤压
#13775: 使信任域方法能够使用有限差分 Hessian…
#13777: DOC: 修复 Ubuntu/Debian 安装说明
#13778: DOC: 删除对 RandomState 的引用
#13782: MAINT: LBFGSB 上 MAXLS 的错误消息已更改,关闭 #11718
#13785: BENCH: 为带权重的 cdist/pdist 添加基准测试
#13786: MAINT: 为 C++ 重构准备 cdist/pdist
#13787: MAINT: stats: 移动 entropy 和 differential_entropy 函数…
#13790: DOC: 为 scipy 开发的 Dockerfile 文档添加一些依赖项
#13792: BUG: stats: 修复 wrapcauchy.cdf 中的广播
#13795: MAINT: stats: 将 hypotests 添加到 init.py 中的 __all__,而不是 stats.py
#13797: MAINT: stats: probplot:仅在需要时绘制最小二乘拟合线…
#13798: MAINT: 修复 `hierarchy.to_tree` 中的不正确代码注释
#13802: DEV: 添加 environment.yml 文件,用于使用 conda/mamba 进行开发
#13803: DOC: 修复有关 arxiv 角色已注册的文档构建警告
#13804: DOC+MAINT: optimize: Bounds 构造函数中的 lb 和 ub 是…
#13807: MAINT: 不要使用并行 Sphinx
#13808: MAINT: cluster.to_tree: 对矩阵的行进行更符合习惯的循环…
#13810: MAINT: 添加 CODEOWNERS 文件
#13811: MAINT: 将 ci 跳过添加到 azp
#13814: ENH/DOC: pydata sphinx 主题润色
#13817: DOC: scipy/linalg/_decomp_ldl.py 中的其他参数类型错误和大小写
#13818: MAINT: stats: 保持 `entropy` 可从 `scipy.stats.distributions` 导入
#13820: BUG: 将 _kendall_p_exact ValueError 更新为 f 字符串
#13831: FIX:DEP: 允许更好地控制 pinv 和 pinvh 的容差…
#13832: BUG: stats: 修复 alpha=1 时 levy_stable 的 rvs
#13833: MAINT: 为 stats.qmc 添加内联类型提示
#13836: MAINT: 修复一些编译器警告
#13838: TST: 放宽 BinomTest 的测试容差
#13841: BLD: 将 `-std=c99` 标志添加到使用…的 scipy.special 扩展
#13845: ENH: stats: 将 `method` 参数添加到 `differential_entropy`…
#13847: TST: 跳过 macOS 上优化失败的测试,将其中一个标记为 xfail
#13848: DOC: optimize: 将 Nelder Mead 文档从无约束最小化中移动…
#13849: DOC: 路线图更新
#13852: CI: 修复 GitHub 上临时错误的 brew 版本
#13854: ENH: 更新 Scipy Gitpod
#13859: TST: 修复超慢的 ttest 排列测试
#13860: MAINT: 清理 LSAP 错误检查
#13863: DOC: 删除示例中的种子
#13865: DOC: optimize: differential_evolution 的 bounds 参数是…
#13866: MAINT: special: 从 _poly_approx 中删除未使用的变量…
#13867: DOC: stats: 解释 fisher_exact 的 alternatives 的含义
#13868: CI: 修复 Linux 上失败的作业
#13870: MAINT: 将 LSAP 矩形矩阵处理移动到求解器代码中
#13871: DOC: 添加 Gitpod 文档
#13876: 工作流:在 Linux 工作流中添加 NumPy 的夜间发布
#13877: DOC: 符合 numpydoc + 统一性
#13879: BUG: signal: 修复 get_window 参数处理并添加测试
#13881: CI: 删除 .travis.yml,从 CircleCI 中删除 codecov
#13882: BLD: 确保递增开发版本字符串
#13886: TST: optimize: 跳过使用UMFPACK的 test_network_flow_limited_capacity 测试…
#13888: MAINT: 修复涉及 elif 条件的问题
#13891: 将 InivariateSpline 重命名为 UnivariateSpline
#13893: ENH: linprog HiGHS 边际/敏感性分析
#13894: DOC: 在 `Return` 部分之前添加空行。
#13897: DOC: BLD: 修复文档构建版本检查,并提高构建时间
#13903: MAINT: Gitpod 修复
#13907: ENH: 使用 pybind11 在 C++ 中重写 minkowski 度量
#13909: 还原 “Workflow : 在 linux 工作流中添加 NumPy 的每日发布”
#13910: DOC: 更新 Readme
#13911: MAINT: 使用内置的 dict 而不是 OrderedDict
#13920: BUG: 在 init 中重新激活 conda 环境
#13925: BUG: stats: Yates 校正的大小 <= abs(观察值-期望值)…
#13926: DOC: 更正 disjoint_set.subsets 文档字符串中的返回类型
#13927: DOC/MAINT: 将版权声明添加到 qmc.primes_from_2_to
#13928: BUG: DOC: signal: 修复 need 参数配置并添加缺失的文档…
#13929: REL: 添加 PEP 621(pyproject.toml 中的项目元数据)支持
#13931: MAINT: special: 去除 _logit.c.src
#13934: ENH: signal: 使 `get_window` 支持 `general_cosine`…
#13940: MAINT: QMCEngine d 输入验证
#13941: MAINT: 前向移植 1.6.3 relnotes
#13944: BUG: spatial: 修复 `distance.sokalmichener` 的权重处理。
#13947: MAINT: 删除 sokalmichener 中的重复计算
#13949: DOC: 在 minimize 和 KDTree.query 中进行少量语法修复
#13951: ENH: 将 Boschloo 精确检验添加到 stats
#13956: ENH: spatial: 添加 `axis` 和 `keepdims` 可选参数…
#13963: MAINT: stats: 修复未使用的导入以及其他一些相关问题…
#13971: DOC: 将 Karl Pearson 的引用添加到卡方检验
#13972: ENH: cluster: 为 `kmeans` 添加一个可选参数 `seed`…
#13973: BLD: 修复 ndimage 中因果/反因果指针的构建警告
#13975: ENH: 将空数组的范数设置为零。
#13977: MAINT: signal: 将 distutils 模板替换为 tempita
#13978: MAINT: 改进某些函数的验证和仅关键字参数…
#13979: ENH: 添加正态分布的对数 CDF 的反函数
#13983: 修复 `ndimage.watershed_ift` 教程的文档
#13987: DOC: 在形态学中的文档字符串中添加示例:white_tophat,…
#13989: DOC: interpolate: 改进 `RegularGridInterpolator` 的示例…
#13990: MAINT, DOC: optimize: 使输入验证解释清晰…
#13992: Workflow : 在 linux 工作流中添加 NumPy 的每日发布
#13995: Doc: 持续集成信息
#14000: BUG: sparse: 修复 DIA.diagonal bug 并添加回归测试
#14004: ENH: 快速加法 dia 矩阵
#14006: MAINT: optimize: 添加验证以检查 func 参数的数量…
#14008: BUG: 为不一致的 WAV 标头引发异常
#14009: DEP: 删除 numpy.compat 的用法
#14010: MAINT: 添加对 wheel DL 代理的支持
#14012: DOC: 扩展精确检验参考
#14015: MAINT: 删除 brew update
#14017: BENCH: 为稀疏算术添加更多格式
#14018: BENCH: 为 f_oneway 添加基准测试
#14020: MAINT: 将 np.int_ 修改为 np.int32,使其在 32/64 位下相同…
#14023: MAINT: 修复 clang 构建并删除一些 Unicode 字符
#14025: BUG: sparse: 修复 DIA.setdiag 问题
#14026: TST: optimize: xfail 部分 test_powell
#14029: CI: github macos 修复
#14030: MAINT: 使用 ‘yield from <expr>’ (PEP 380)
#14031: MAINT: 新式类,删除对对象的继承
#14032: MAINT: Pythran 的 CXXFLAGS
#14033: ENH: 将 sqeuclidean 和 braycurtis 移植到 _distance_pybind
#14034: MAINT: 清理 ‘next = __next__’
#14045: MAINT: 增加 PYVER pavement.py
#14047: DEV: 在 Gitpod Dockerfile 中初始化 boost 子模块
#14051: BLD: 如果缺少 boost 子模块内容,则尽早报错
#14052: DOC: 缺少子模块初始化信息
#14057: DOC: special: 将示例添加到 `psi` 文档字符串
#14058: BUG: 修复了 linalg.solve 中的 dtype bug。
#14060: Doc: 修复 spence 函数文档中的拼写错误。
#14061: MAINT:stats: _sobol.pyx 的类型注释
#14062: DOC: quickstart_gitpod.rst 中的一些小修复
#14063: DOC: signal: 将示例添加到 `cont2discrete` 文档字符串
#14064: DOC: optimize: 将示例添加到 fmin_bfgs 文档字符串
#14065: 在文档字符串下添加 scipy stats.trim1 的示例
#14066: DOC 将示例添加到 scipy.special.hermite
#14067: DOC 添加 alpha 文档字符串描述,将示例添加到文档字符串
#14070: DOC 添加参数、返回和示例到文档字符串
#14072: MAINT/TST: 修复由于 numpy 的每日构建而失败的测试。
#14075: DOC 改进 signal.hilbert 文档字符串中的代码片段。
#14076: DOC: 记录 cdist/pdist 接受 Jensen-Shannon 距离
#14079: BLD: 避免在 cythonize 阶段导入 scipy.stats
#14082: MAINT: 删除旧的、注释掉的 extract_diagonal
#14083: MAINT: sparse: 删除已失效的函数 extract_diagonal
#14085: ENH: 在 _distance_pybind 中实现堪培拉距离
#14086: MAINT: 清理 scipy 命名空间中最好从…导入的条目
#14088: 从源代码为 python 3.10 安装 Pythran
#14092: BUG: 修复 clang 问题。
#14094: DOC: 更正类中 Default 的不一致定义…
#14105: TST: stats: mannwhitneyu: 检查 mstats 和 stats mannwhitneyu 是否…
#14106: DOC: stats.mstats: mannwhitneyu: 返回的统计量是…
#14107: ENH: stats: bootstrap: 添加 `vectorized` 参数;自动…
#14109: BUG: 修复 fblas 签名文件中的两个问题
#14110: DOC: mailmap 更新
#14113: ENH: stats: bootstrap: 添加 `paired` 参数
#14116: MAINT: 修复 odr 中已弃用的 Python C API 用法
#14118: DOC: 1.7.0 发行说明
#14125: DOC: 修复拼写错误
#14126: ENH: stats: bootstrap: 添加 `batch` 参数来控制批处理…
#14127: CI: 升级基准测试 CI 运行中的 pip
#14130: BUG: 如果将 verbose 设置为 2,则修复 trust-constr 报告 TypeError…
#14133: MAINT: interpolate: 引发 NotImplementedError 而不是 ValueError
#14139: FIX/DOC: lsqr doctests 打印失败
#14145: MAINT: 1.7.x 版本引脚(“反向移植”)
#14146: MAINT: 如果没有标签,则计算提交次数
#14164: TST, BUG: 修复 rbf 矩阵值
#14166: CI, MAINT: 限制预发布 CI
#14171: TST: signal: 提高 Gustafsson 测试的容差…
#14175: TST: stats: 放宽一些 binomtest 测试的容差。
#14182: MAINT: stats: 更新 ppcc_plot 和 ppcc_max 文档字符串。
#14195: MAINT: download-wheels 缺少导入
#14230: REL: 停止在 sdist 中发布生成的 Cython 源代码