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SciPy 1.13.0 发布说明#

SciPy 1.13.0 是 3 个月辛勤工作的成果。 此带外发布旨在支持 NumPy 2.0.0，并向后兼容 NumPy 1.22.4。 用于构建 PyPI 轮子的 OpenBLAS 版本已增加到 0.3.26.dev。

此版本需要 Python 3.9+ 和 NumPy 1.22.4 或更高版本。

在 PyPy 上运行，需要 PyPy3 6.0+。

此版本亮点#

  • 支持 NumPy 2.0.0。

  • 文档中添加了交互式示例，允许用户在其浏览器中嵌入的 Jupyterlite 笔记本电脑上本地运行示例。

  • COO 和 DOK 稀疏格式的初步 1D 数组支持。

  • 几个 scipy.stats 函数已获得对附加 axis、nan_policy 和 keepdims 参数的支持。scipy.stats 也有一些性能和准确性方面的改进。

新特性#

scipy.integrate 改进#

  • scipy.integrate.solve_ivp events 可调用对象的 terminal 属性现在另外接受整数值，以指定终止所需的发生次数，而不是之前仅接受 bool 值以在第一个注册事件时终止的限制。

scipy.io 改进#

scipy.interpolate 改进#

  • 通过新的 method 参数，已将修改后的 Akima 插值添加到 interpolate.Akima1DInterpolator。

  • 新方法 BSpline.insert_knot 将一个节点插入到 BSpline 实例中。 此例程类似于模块级别的 scipy.interpolate.insert 函数，并且与 BSpline 对象而不是 tck 元组一起使用。

  • RegularGridInterpolator 获得了原地计算导数的功能。 例如，RegularGridInterolator((x, y), values, method="cubic")(xi, nu=(1, 1)) 计算混合二阶导数，\(\partial^2 / \partial x \partial y\) 在 xi 处的值。

  • RegularGridInterpolator 的张量积样条方法的性能特征已更改：求值速度应明显更快，而构建速度可能会较慢。 如果您在构建时间方面遇到问题，则可能需要尝试可选的关键字参数 solver 和 solver_args。可以通过 “*_legacy” 方法获得先前的行为（快速构建，缓慢求值）：method="cubic_legacy" 与先前版本中的 method="cubic" 完全等效。有关详细信息，请参见 gh-19633。

scipy.signal 改进#

  • 许多滤波器设计函数现在改进了对采样频率 (fs) 的输入验证。

scipy.sparse 改进#

  • coo_array 现在支持 1D 形状，并且为 min、max、argmin 和 argmax 提供了额外的 1D 支持。 DOK 格式现在也具有初步的 1D 支持，但在编写时仅支持简单的整数索引。

  • 已添加对 scipy.sparse.csgraph 的 pydata/sparse 数组输入的实验性支持。

  • dok_array 和 dok_matrix 现在有了 fromkeys 的正确实现。

  • csr 和 csc 格式现在改进了 setdiag 的性能。

scipy.spatial 的改进#

  • 当长宽比倾斜时，voronoi_plot_2d 现在可以更清晰地绘制到无穷远的 Voronoi 边。

scipy.special 的改进#

  • 所有 Fortran 代码，即大多数特殊函数所依赖的 AMOS、specfun 和 cdflib 库，都已移植到 Cython/C。

  • 函数 factorialk 现在还支持使用 exact=False 进行更快的近似计算。

scipy.stats 的改进#

已弃用的功能#

  • PchipInterpolator 和 Akima1DInterpolator 中的复数 dtypes 已被弃用，并且将在 SciPy 1.15.0 中引发错误。如果您尝试使用传递数组的实部，请在 y 上使用 np.real。

  • 对于 scipy.special.factorial，n 的非整数值与 exact=True 一起使用已被弃用。

已过期的弃用#

目前正在努力执行长期存在的弃用。以下先前已弃用的功能受到影响

  • scipy.signal.{lsim2,impulse2,step2} 已被删除，取而代之的是 scipy.signal.{lsim,impulse,step}。

  • 窗口函数不能再从 scipy.signal 命名空间导入，而应通过 scipy.signal.windows 或 scipy.signal.get_window 访问。

  • scipy.sparse 不再支持多重省略号索引

  • scipy.signal.{bspline,quadratic,cubic} 已被删除，取而代之的是 scipy.interpolate 中的替代方案。

  • scipy.linalg.tri{,u,l} 已被删除，取而代之的是 numpy.tri{,u,l}。

  • 带有 exact=True 的 scipy.special.factorial 中的非整数数组现在会引发错误。

  • NumPy 主命名空间中在 SciPy 主命名空间中公开的函数（例如 scipy.histogram 公开的 numpy.histogram）已从 SciPy 的主命名空间中删除。请直接从 numpy 使用这些函数。这最初是为 SciPy 1.12.0 执行的，但未包含在发行说明中，因此在此处包含以确保完整性。

不兼容的向后变更#

其他变更#

  • scipy.stats.moment 的第二个参数已重命名为 order，同时保持向后兼容性。

作者#

  • 姓名（提交）

  • h-vetinari (50)

  • acceptacross (1) +

  • Petteri Aimonen (1) +

  • Francis Allanah (2) +

  • Jonas Kock am Brink (1) +

  • anupriyakkumari (12) +

  • Aman Atman (2) +

  • Aaditya Bansal (1) +

  • Christoph Baumgarten (2)

  • Sebastian Berg (4)

  • Nicolas Bloyet (2) +

  • Matt Borland (1)

  • Jonas Bosse (1) +

  • Jake Bowhay (25)

  • Matthew Brett (1)

  • Dietrich Brunn (7)

  • Evgeni Burovski (65)

  • Matthias Bussonnier (4)

  • Tim Butters (1) +

  • Cale (1) +

  • CJ Carey (5)

  • Thomas A Caswell (1)

  • Sean Cheah (44) +

  • Lucas Colley (97)

  • com3dian (1)

  • Gianluca Detommaso (1) +

  • Thomas Duvernay (1)

  • DWesl (2)

  • f380cedric (1) +

  • fancidev (13) +

  • Daniel Garcia (1) +

  • Lukas Geiger (3)

  • Ralf Gommers (147)

  • Matt Haberland (81)

  • Tessa van der Heiden (2) +

  • Shawn Hsu (1) +

  • inky (3) +

  • Jannes Münchmeyer (2) +

  • Aditya Vidyadhar Kamath (2) +

  • Agriya Khetarpal (1) +

  • Andrew Landau (1) +

  • Eric Larson (7)

  • Zhen-Qi Liu (1) +

  • Christian Lorentzen (2)

  • Adam Lugowski (4)

  • m-maggi (6) +

  • Chethin Manage (1) +

  • Ben Mares (1)

  • Chris Markiewicz (1) +

  • Mateusz Sokół (3)

  • Daniel McCloy (1) +

  • Melissa Weber Mendonça (6)

  • Josue Melka (1)

  • Michał Górny (4)

  • Juan Montesinos (1) +

  • Juan F. Montesinos (1) +

  • Takumasa Nakamura (1)

  • Andrew Nelson (27)

  • Praveer Nidamaluri (1)

  • Yagiz Olmez (5) +

  • Dimitri Papadopoulos Orfanos (1)

  • Drew Parsons (1) +

  • Tirth Patel (7)

  • Pearu Peterson (1)

  • Matti Picus (3)

  • Rambaud Pierrick (1) +

  • Ilhan Polat (30)

  • Quentin Barthélemy (1)

  • Tyler Reddy (117)

  • Pamphile Roy (10)

  • Atsushi Sakai (8)

  • Daniel Schmitz (10)

  • Dan Schult (17)

  • Eli Schwartz (4)

  • Stefanie Senger (1) +

  • Scott Shambaugh (2)

  • Kevin Sheppard (2)

  • sidsrinivasan (4) +

  • Samuel St-Jean (1)

  • Albert Steppi (31)

  • Adam J. Stewart (4)

  • Kai Striega (3)

  • Ruikang Sun (1) +

  • Mike Taves (1)

  • Nicolas Tessore (3)

  • Benedict T Thekkel (1) +

  • Will Tirone (4)

  • Jacob Vanderplas (2)

  • Christian Veenhuis (1)

  • Isaac Virshup (2)

  • Ben Wallace (1) +

  • Xuefeng Xu (3)

  • Xiao Yuan (5)

  • Irwin Zaid (8)

  • Elmar Zander (1) +

  • Mathias Zechmeister (1) +

总共有 96 人为此次发布做出了贡献。名字旁边带有“+”号的人是首次贡献补丁。此名称列表为自动生成，可能不完全完整。

1.13.0 版本关闭的问题#

  • #1603: 对于小的二项式概率，二项式 ppf 给出错误的结果…

  • #2254: linalg.eig 测试失败 (test_singular) (Trac #1735)

  • #8398: CDFLIB 的精度太低

  • #9950: 对于单变量数据，kmeans2 中的“++”初始化失败

  • #10317: 对于 p=1，scipy.stats.nbinom.interval 返回错误的结果

  • #10569: API: scipy.fft 和 numpy.fft 中的 `s` 参数不同

  • #11359: 当输入 b 为 0 维时，lfilter 错误

  • #11577: 广义特征值有时是错误的（在某些硬件上）

  • #14001: Pycharm scipy SVD 返回错误代码，没有消息

  • #14176: 添加在 n 个事件后终止求解器的选项

  • #14220: dctn/idctn 的 s 参数文档令人困惑

  • #14450: 将 numpy 数组作为采样频率传递给 signal.iirfilter…

  • #14586: 释放矩阵内存的问题

  • #15039: BUG: sparse.dok_matrix.fromkeys 方法完全不起作用

  • #15108: BUG: PROPACK 中 scipy.sparse.linalg 测试中的段错误

  • #16098: BLD:1.8.0: SciPy 未准备好进行 LTO

  • #16792: BUG: 手动向量化 scipy.linalg.expm 在版本中失败…

  • #16930: BUG: 当 incx 时，scipy.linalg.blas.dnrm2 可能返回错误结果…

  • #17004: `Test_SVDS_PROPACK.test_small_sigma2` 测试的测试失败…

  • #17125: BUG: osx-64 scipy 1.9.1 test_bad_geneig 数值错误

  • #17172: BUG: 对于只读，scipy.linalg.expm、coshm、sinhm 和 tanhm 失败…

  • #17362: 添加对 Flexiblas 的支持

  • #17436: BUG: linalg.cholesky：大型矩阵出现段错误

  • #17530: `scipy.stats.wilcoxon(x, y)` 中的不必要近似

  • #17681: BUG: special: `pbvv_seq` 已损坏。

  • #18086: BUG: `scipy.linalg.expm` 在之间生成不一致的结果…

  • #18089: DOC: <由于窗口造成的缩放对于频谱和密度不清楚>

  • #18166: ENH: stats.vonmises.pdf: 当 kappa=0 时返回 1/(2pi)

  • #18408: MAINT：在没有原生 meson 的过渡期内 C++17 的状态…

  • #18423: ENH: 将 SDMN Fortran 例程添加到 Python 包装函数中。

  • #18678: BUG: 对于 df.size > 500，scipy.special.stdtrit 不是线程安全的

  • #18722: DOC: 在 optimize.quadratic_assignment 2opt 方法中，partial_match…

  • #18767: NumPy 上的过于严格的版本限制破坏了发行版构建

  • #18773: BUG: 更新最旧支持的 numpy 元数据

  • #18902: DOC：使 scipy.optimize.linprog 中的默认边界更明显

  • #19088: `pull-request-labeler` 行为异常，因此再次禁用

  • #19181: TST：改进数组 API 测试跳过装饰器

  • #19225: 使用自己的优化器（例如使用 Nelder-Mead）的 stats.t.fit() 失败…

  • #19486: 查询：cdflib 在 SciPy 代码中的哪个位置使用？

  • #19573: scipy.fft.fht - 文档问题

  • #19584: BUG: MATLAB expm 与 scipy.linalg.expm: 溢出/无效值…

  • #19596: BENCH: spatial.distance.* “非 xdist” 基准

  • #19605: BUG: 当前，wheel 运行有*大量*测试失败。

  • #19642: 加快 Mann-Whitney U 检验

  • #19653: ENH: Voronoi 图从 scipy.spatial 中给出意外结果

  • #19659: BUG: savemat(…, format=”4”) 错误地抛出 ValueError 错误…

  • #19678: BUG: 当输入…时，scipy.stats.theilslopes 返回无效数据

  • #19683: BUG/TST: cluster: {`kmeans`,…}的 `seed` 参数的错误测试

  • #19729: DOC：使用 jupyterlite-sphinx 添加交互式示例

  • #19732: DOC: 取决于删失类型的似然函数

  • #19733: BUG: 未强制执行 `pythran` 的最低版本

  • #19737: TST: io: `test_fortranfiles_mixed_record` 在 numpy 中失败…

  • #19739: BUG: 由于符号…，复杂值的 pchip 插值出现错误

  • #19740: CI, MAINT: 一些针对 Python 版本的简单清理

  • #19754: MAINT, TST: test_public_api.py 可能会通过…使用 NumPy main 失败

  • #19767: 上游修复了 SuperLU 的构建警告

  • #19772: DOC: stats: `scipy.stats.crystalball` 的文档字符串需要…

  • #19774: DOC：详细说明“concatenate”在 `spatial.transform.Rotation.concatenate` 上下文中的含义

  • #19799: DOC：数组类型：更新数组验证指南

  • #19813: BUG: specfun.f 中有错别字？

  • #19819: BUG: 在 RBFInterpolator 中，如果 degree=-1，则警告消息错误

  • #19831: 使用 OpenBLAS 0.3.26 测试失败

  • #19835: DOC: 子包列表中缺少 `fft`

  • #19836: DOC：删除关于子包导入的不正确句子

  • #19846: CI：预发布 Linux 作业不再使用 NumPy 预发布版本

  • #19848: `_lib._util.MapWrapper` 使用带有 `fork` 的多处理，…

  • #19854: 对于 return_sign=True 的复数输入，scipy.special.logsumexp…

  • #19862: DOC：稀疏矩阵的转置运算符的文档…

  • #19867: 预发布版本中出现新的 ndimage 和 RBFInterpolator 测试失败…

  • #19896: BUG: `special.nctdtr` 在 main 中损坏

  • #19897: DOC: scipy.stats.unitary_group 未指定 dim>1

  • #19928: TST：special：数组类型：使用 `torch` 后端进行测试容差失败

  • #19943: BUG: sparse: CSC.setdiag 比转换为 LIL 并…慢

  • #19948: BUG: 当提供的 x0 求解…时，scipy.sparse.linalg.gmres 失败

  • #19951: BUG: 布尔掩码对于稀疏数组类已损坏

  • #19963: DOC: scipy.optimize 参数尺度差异很大

  • #19974: DOC/REL: 追溯地将缺失的已过期弃用添加到 1.12.0…

  • #19991: BUG: 当指定…时，使用 Nelder-Mead 方法的 Scipy Optimize 出现问题

  • #19993: BUG: F_INT 类型与 INTEGER 类型 f2py 转换冲突…

  • #19998: DOC: splrep 中的边界条件

  • #20001: BUG: scipy.stats.loglaplace 可能返回负矩

  • #20009: BUG: ShortTimeFFT 处理复数输入时失败

  • #20012: MAINT: 在…中使用 NumPy sliding_window_view 代替 as_strided

  • #20014: TST: signal: TestCorrelateReal 在 Meson 3.12 作业中失败

  • #20027: BUG: `sparse.random` 在 1.12 版本中返回转置数组

  • #20031: TST: 优先使用 `pytest.warns` 而不是 `np.testing.assert_warns`

  • #20034: TST: linalg: test_decomp_cossin.py::test_cossin_separate[float64]…

  • #20036: MAINT: 实现 scipy.stats.powerlaw._munp

  • #20041: BUG: 将 LinearConstraint 与 optimize.differential_evolution 一起使用

  • #20042: BUG: scipy.stats.percentileofscore 存在错误

  • #20043: 使用相等性比较浮点数 (test_bootstrap_alternative)

  • #20060: BUG: 堆叠两个 dok_array 会产生关于…的 NotImplementedError

  • #20062: MAINT, TST: 针对 NumPy main 的测试失败

  • #20071: MAINT: 文档构建警告

  • #20075: BUG: `eigh_tridiagonal` 使用 `select=”i”` 时，对于 1x1 矩阵失败

  • #20084: BUG: `import scipy._lib._testutils` 在某些情况下引发异常…

  • #20100: ENH: 在 scipy.optimize 命名空间中公开 NoConvergence 错误类

  • #20107: MAINT: 构建在 NumPy main 上失败

  • #20129: BUG: 回归：eval_chebyt 对复数给出错误结果…

  • #20131: DOC: linalg: `qr` 的输出 `P` 的描述不清楚。

  • #20142: Kstwobign 分布的文档中的拼写错误

  • #20156: BUG: 由于…，sparse.dok_matrix 为有效的 pop(key) 引发 KeyError

  • #20157: MAINT, TST: test_svds_parameter_tol 失败

  • #20161: `dev.py test` 不能同时接受 `–argument` 和 `–…`

  • #20170: 由于 `asarray(…, copy=False)` 语义更改导致的测试失败…

  • #20180: GHA wheel 构建作业中 Node.js 16 的弃用警告

  • #20182: BUG: `csr_row_index` 和 `csr_column_index` 对于混合类型错误…

  • #20188: BUG: 将 scipy.spatial.transform.Rotation 提升到 0 次幂会添加…

  • #20214: BUG: minimize(method=”newton-cg”) 因 UnboundLocalError 而崩溃…

  • #20220: macOS arm64 作业中使用 Homebrew Python 在 Cirrus 上的新问题

  • #20225: CI/MAINT: `choco` 因无效凭据而出现错误

  • #20230: CI, DOC, TST: 与 scipy/stats/_distn_infrastructure.py 相关的失败…

  • #20268: MAINT: 失败的预发布依赖作业 - “numpy.broadcast 大小已更改”

  • #20291: BUG: 宏冲突 (`complex`) 与 amos 代码中的 Windows SDK

  • #20294: BUG: 在 Windows 上，使用 1.13rc1 和 1.14.dev 版本的 scikit-learn 出现挂起

  • #20300: BUG: 由于 pocketfft…，SciPy 1.13.0rc1 无法在旧版 macOS 上构建

  • #20302: BUG: scipy.optimize.nnls 因异常而失败

  • #20340: BUG: 由于条件错误，line_search_wolfe2 未能收敛

  • #20344: MAINT/DOC: 删除关于 NumPy 导入的过时说明

1.13.0 的拉取请求#

  • #8404: ENH:special: 将 cdflib 精度提高到 1e-15

  • #14771: ENH: integrate.solve_ivp: 允许事件 `terminal` 属性…

  • #16660: DOC: 更新 pydata-sphinx 主题

  • #17265: Doc: 修复 linalg.lstsq 关于残差的文档

  • #17525: TST: linalg: 暂时静默 test_solve_generalized_discrete_are 中的失败

  • #18530: ENH: sparse: 通用化 coo_array 以支持 1d 形状

  • #18541: MAINT: sparse: 停止支持多省略号索引

  • #18828: ENH: 改进 wavfile.write 中的 dtype 检查

  • #19444: ENH: 添加更快的逆 Wishart rvs 和 logpdf

  • #19488: DOC: 改进用户指南中的“频谱分析”部分

  • #19541: BUG: 修复余弦距离结果类型

  • #19545: ENH: integrate._tanhsinh: 支持向量值函数

  • #19555: DOC: `ShortTimeFFT` 的小文档和文档字符串更正

  • #19560: ENH:MAINT:special: Cythonize cdflib

  • #19587: ENH:MAINT:special: 重写 amos F77 代码

  • #19631: ENH: 在 stats.boxcox_normmax 中添加参数 ymax

  • #19633: ENH: 在 RegularGridInterpolator 中使用 NdBSpline 来加速评估

  • #19650: ENH: stats.kstests: 添加 axis / nan_policy / keepdims 支持

  • #19662: ENH: stats.normaltest/skewtest/kurtosistest: 添加 axis / nan_policy…

  • #19663: DOC: 为 rv_continuous.fit 添加示例

  • #19664: DOC: 为 mstats.brunnermunzel 添加示例

  • #19666: DOC: 为 lbfgsb docstring 添加示例

  • #19667: ENH: integrate._nsum: 用于有限和无限求和的函数

  • #19669: REL: 将版本设置为 1.13.0.dev0

  • #19672: DEP: signal: 删除 scipy.signal.{bspline,quadratic,cubic}

  • #19674: DEP: linalg: 删除 tri{,u,l}

  • #19675: DEP: signal: 删除 scipy.signal.{lsim2,impulse2,step2}

  • #19676: DEP: signal: 删除从 signal…导入窗口函数的功能

  • #19679: MAINT: stats.theilslopes: `x` 和 `y` 的一致提升

  • #19680: ENH: stats.shapiro: 添加 axis / nan_policy / keepdims 支持

  • #19681: MAINT: 将 binom 添加到新的 C++ 特殊库及其 cephes…

  • #19682: TST: 合并数组 API 测试跳过装饰器

  • #19687: MAINT:linalg: 删除冗余的 det 和 lu Fortran 文件

  • #19689: MAINT: stats.moment: 将参数 `moment` 重命名为 `order`

  • #19694: MAINT: 删除 `PDistWeightedMetricWrapper` 和 `CDistWeightedMetricWrapper`

  • #19695: MAINT: 优先使用 `np.fill_diagonal` 而不是 `diag_indices`

  • #19696: ENH: 向 `interpolate.Akima1DInterpolator` 添加 `method` 参数

  • #19698: MAINT: 提高项目版本

  • #19701: MAINT: 使 `array_api_compat` 的导入更友好

  • #19703: DEP: `factorial(…, exact=True)` 中的非整数：弃用…

  • #19708: DOC: spatial.distance: 添加缺少的可选参数标记

  • #19710: TST: 修复使用可编辑安装的 pytest 发现错误

  • #19711: DOC: 澄清 ttest_1samp 参数

  • #19714: BLD: 要求 Cython >=3.0.4，删除 0.29.X 支持

  • #19715: ENH: sparse: 为 1d 添加 DOK 支持 (不进行索引)

  • #19716: ENH: 为 factorialk 启用近似计算

  • #19721: DOC: 添加 88 个字符行长度的理由

  • #19722: DOC: 更新发布版本过程

  • #19723: ENH, MAINT: voronoi_plot_2d 更友好的无穷线

  • #19724: MAINT: Windows NumPy 2.x int shims

  • #19725: MNT：在 Cython 代码中使用 int 而不是 long

  • #19728: MAINT：增强 `pull-request-labeler` 的配置...

  • #19730: MAINT：bs4 弃用填充

  • #19731: ENH：stats.mood：添加 nan_policy / keepdims 支持

  • #19738: BLD：要求 `pythran>=0.14.0`

  • #19741: ENH：stats.friedmanchisquare/brunnermunzel：添加 axis / nan_policy...

  • #19742: CI：修复 PR 标签器配置文件

  • #19743: ENH：sparse：添加最小-最大 1d 支持和测试

  • #19744: ENH：stats.mannwhitneyu：速度改进，内存减少...

  • #19745: TST：fortranfiles 修复

  • #19746: CI：添加基于 issue/PR 标题的标签器

  • #19749: ENH：stats.mannwhitneyu：向量化统计量计算

  • #19750: DEV/BLD：生成 `requirements/*` 文件以简化构建

  • #19752: DEP：弃用 `PchipInterpolator` 和 `Akima1DInterpolator` 中的复数数据类型

  • #19755: MAINT/TST：当不在 array API 中时忽略后端导入错误...

  • #19757: ENH：添加向量化标量最小化括号查找器

  • #19758: MAINT：更正不准确的注释

  • #19760: MAINT：interpolate：删除死代码

  • #19762: ENH：stats.monte_carlo_test：考虑不精确计算...

  • #19763: MAINT：integrate._nsum：调整用于确定数量的算法...

  • #19768: MAINT：SuperLU 上游修复以解决编译警告

  • #19770: ENH：stats.wilcoxon：重写以提高速度和清晰度；添加 PermutationMethod...

  • #19773: DOC：stats：scipy.stats.crystalball 的文档字符串需要一个...

  • #19775: DOC：Rotation.concatenate 的文档字符串和示例

  • #19776: ENH：stats.rankdata：向量化计算

  • #19777: ENH：添加 `BSpline.insert_knot` 方法

  • #19778: DOC，MAINT：修复 rel 进程中的 make dist

  • #19780: MAINT：scipy.stats：替换 `_normtest_finish`/`_ttest_finish` 等等...

  • #19781: CI，MAINT：切换到稳定的 python 版本

  • #19786: BLD：修复 meson-log.txt 中的“无法猜测安装标签”，添加...

  • #19787: DOC/BLD：macOS Homebrew OpenBlas 检测建议

  • #19788: DOC：stats.trim_mean：更正文档

  • #19790: BENCH：为各个距离度量添加了基准测试

  • #19792: MAINT：简化 `t.logpdf`

  • #19796: API：为 csgraph 模块启用 `pydata/sparse` 输入

  • #19803: TST：stats：将几何 zscore 与朴素版本进行比较...

  • #19807: DOC：fft：添加关于 FHT 公式的注释

  • #19808: MAINT：移动逐元素算法和框架

  • #19810: MAINT：也为 Cython 代码设置 `NPY_NO_DEPRECATED_API`

  • #19811: BLD：将默认 `cpp_std` 设置为 `c++17`

  • #19818: MAINT：uarray CXX 版本十六进制清理

  • #19820: TST：linalg：测试 Cython LAPACK 复数 ladiv

  • #19821: BLD：解决 lsoda/vode 中缺少原型警告

  • #19822: BLD：propack：解决缺少返回值警告

  • #19823: CI/DEV：添加一些新的自动标签

  • #19824: ENH：用 C 重写 specfun F77 代码

  • #19825: MAINT：`CODEOWNERS` 语法修复和更改

  • #19827: MAINT：spatial：修复 `ckdtree` 代码中的构建警告

  • #19828: CI/DEV：修复和简化 `label-globs` 语法

  • #19829: MAINT：interpolate：修复来自 `_ppoly.pyx` 的构建警告

  • #19837: MAINT：special：修复 meson 弃用警告

  • #19838: DOC：fft：改进实数变换的 `s` 描述

  • #19843: DOC：将 `fft` 添加到教程中的子模块列表

  • #19844: TST：修复来自 np.load() 的更多 fd 泄漏案例

  • #19849: CI：修复预发布作业以使用 numpy 2.0，并添加第二个作业...

  • #19853: ENH：sparse：1D 数组的基础（添加测试套件，四舍五入...

  • #19855: BLD：改进 BLAS/LAPACK G77 ABI 包装器并修复 PROPACK 段错误

  • #19856: BLD：简化 meson 中的 pythran 版本要求

  • #19857: BLD：使 scipy 在启用 LTO 的情况下构建无警告

  • #19860: MAINT：修复 BLD 标签错字

  • #19861: BUG：io：跳过单个代码点的 arr_to_chars 调用

  • #19864: 添加文档以解释转置 csr 或...

  • #19866: DOC：更改 scipy.optimize.linprog 中 bounds 的默认值

  • #19868: MAINT：修复 `unique(…, return_inverse=True)` 的使用

  • #19869: MAINT：数组类型：将 `as_xparray` 重命名为 `_asarray`

  • #19870: MAINT：logsumexp：正确处理复数符号

  • #19871: MAINT：在 `stats._distn_infrastructure` 中进行 isinstance 检查...

  • #19874: rankdata：确保空输入的正确形状

  • #19876: MAINT：stats：添加测试以确保 `wasserstein_distance` 和 `wasserstein_distance_nd` 的不同后端之间的一致性

  • #19880: DOC：准备 1.13.0 发行说明

  • #19882: MAINT：将 `pocketfft` 作为 git 子模块供应商

  • #19885: MAINT：修复一些小的 array API 支持问题

  • #19886: TST：stats：修复一些关于不可重现种子的问题

  • #19891: MAINT：stats：修复 `qmc` 和 MPL 相关中的可编辑安装问题...

  • #19893: MAINT：删除 scipy.interpolate._interpolate 中未使用的 itertools 导入

  • #19901: MAINT：special：从 `_cdflib.pyx` 中删除 `numpy.math` 的使用

  • #19902: BUG：special：cdflib：更正 cdftnc Cython 错误

  • #19908: 修复 AIX 构建中断。

  • #19909: MAINT：linalg：调整 lwork/liwork 更改 OpenBLAS 0.3.26

  • #19916: MAINT：更新 pocketfft git 子模块位置

  • #19917: MAINT：在 python 中复制 FITPACK 的 `fpchec` 例程

  • #19924: TST：cluster：修复 test_kmeans_and_kmeans2_random_seed

  • #19925: MAINT：向前移植 1.12.0 发行说明

  • #19927: BUG：cluster.kmeans*：数组类型：接受 `int` 作为 k

  • #19929: DOC：更新了关于子包导入的不正确句子。请参阅...

  • #19931: MAINT：special：cdflib：进一步细化容差

  • #19932: ENH：stats：为 gamma.fit(‘mm’) 使用显式公式

  • #19933: BUG：正确处理 special stdr 函数中的 -inf

  • #19934: BUG：special：amos：修复 AMOS C 翻译中的一些错误

  • #19937: TST：为 TestInvgauss 和 TestLaplace 添加 RNG 种子

  • #19938: MAINT：special：数组类型：修复不在 array API 中时的警告...

  • #19939: BUG：special：amos：修复 `amos_asyi` 中的退出路径

  • #19942: MAINT：hypothesis：记录最低要求的版本

  • #19944: BUG：正确处理二项式中的 inf 支持

  • #19945: BLD：修复 `__config__.py` 中的转义序列问题

  • #19947: BUG：special：amos：修复 `amos_mlri` 中的错字

  • #19950: DOC：stats.logrank：修复影响手册中生存曲线的错字

  • #19952: BUG：sparse：当 x0 已经解决问题时，为 gmres 添加提前退出

  • #19957: 缺陷：sparse：形状错误的 1 维布尔掩码应引发 IndexError

  • #19961: 文档：向文档添加版本警告横幅

  • #19962: 增强：sparse：通过转换为 coo 加快 csr/csc setdiag 的速度

  • #19965: 文档：optimize.curve_fit 中参数的尺度

  • #19969: 文档：修复暗黑主题的着陆页图像

  • #19971: 增强：signal.filter...中采样频率的输入验证

  • #19975: 增强：在 goodness_of_fit 函数中支持自定义统计量 (gh-19894)

  • #19977: 文档：记录 invgauss 的一种常见的替代参数化方法。

  • #19978: 文档：修复 scipy.signal.ShortTimeFFT.t/T 在...下的自动摘要

  • #19980: 增强：stats：向 `f_oneway` 和 `alexandergovern` 添加轴/nan_policy 支持

  • #19981: 测试：更正 TestGamma.test_fit_mm 函数中的错别字。

  • #19995: 测试，维护：test_immediate_updating 修复

  • #19997: 维护：调整代码库以适应新的 `np.array` 的 `copy`...

  • #20000: 维护：interpolate：解决关于 NdBSpline/RGI 的评审意见

  • #20003: 维护：sparse：将 coo_matrix.indices 更改为 coo_matrix.coords

  • #20004: 维护：sparse：将方法名称 _mul_* 更改为 _matmul_* 全部...

  • #20005: 维护：从 `__all__` 中删除 partial（已从子模块中删除）

  • #20006: 基准：optimize：向全局优化器基准添加计时

  • #20010: 错误：为 `ShortTimeFFT` 的单边情况添加正确的错误消息...

  • #20013: 维护：signal：使用 `sliding_window_view` 而不是 `as_strided`

  • #20016: 文档：更新发布文档以反映新的版本横幅

  • #20017: 错误：loglaplace 矩应该是非负的。

  • #20018: 增强：在 log-Laplace 文档中引用 Laplace 分布。

  • #20019: 文档：添加对使用 jupyterlite-sphinx 的交互式示例的支持

  • #20020: 测试：TestCorrelateReal 溢出垫片

  • #20021: 增强：修复 boxcox_llf 中零附近的数值不稳定性

  • #20023: 增强：当已知 loc 时，使用 log-laplace MLE 的解析公式。

  • #20024: 增强：stats：添加多元 Wasserstein 距离作为单独的...

  • #20032: 维护：调整特殊 C++ 库中的一些注释

  • #20033: 维护：sparse：取消弃用 getnnz()

  • #20037: 维护：在 digamma 中添加对复数无穷输入的特殊处理

  • #20039: 增强：在 scipy.stats.powerlaw._munp() 中使用解析公式。

  • #20044: 测试：_ConstraintWrapper 返回正确形状的违规

  • #20045: 文档：在教程中添加缺失的 np。

  • #20047: 测试：在 test_bootstrap_alternative 中使用 assert_allclose

  • #20052: 修复：允许 ndimage 输出的任何 dtype 指定符

  • #20053: 添加对 partial_match 和 partial_guess 的排序要求

  • #20054: 错误：SciPy.interpolate.CubicSpline 使用周期性数据

  • #20063: 增强：optimize._differentiate：添加选项 preserve_shape

  • #20065: 维护 修复 `scipy.stats._multivariate.py` 中的断开链接

  • #20067: 测试：NumPy fft 更改的垫片

  • #20068: 将 stats 测试中的 assert_warns 更改为 pytest.warns。

  • #20069: 维护/文档：`special.nrdtrimn/nrdtrisd` 文档字符串修复

  • #20070: 维护：消除 ruff 弃用警告

  • #20076: 错误：linalg：为 1x1 输入向 eigh_tridiagonal 添加提前退出

  • #20078: CI：更新 github actions 和 cibuildwheel

  • #20080: 错误：sparse：修复 dok_array 的 hstack 等

  • #20086: 维护：以不同的方式检测 musl。

  • #20087: 维护：从 `numpy.array_api` 切换到 `array-api-strict`

  • #20092: 文档：修复几个被解析为替换引用的地方...

  • #20093: 文档：修复 `signal.rst` 和 `_short_time_fft.py` 中的小错别字

  • #20095: 文档：将张量积样条从路线图中删除

  • #20096: 测试：linalg：减小 cossin 测试的大小

  • #20098: 维护：小的数组 API 跳过改进

  • #20101: 维护：scipy.stats.vonmises 的文档字符串中的编辑更改。

  • #20102: 增强：使用非平凡的界限来求解 vonmises MLE 的 kappa。

  • #20103: 维护：optimize：公开 `NoConvergence`

  • #20104: 增强：允许 vonmises 分布中的形状参数 kappa 为零。

  • #20106: 文档：更新 stats.percentileofscore 的文档字符串

  • #20108: 维护：descr->f 访问的垫片

  • #20111: 文档：阐明 `unitary_group` 中 `dim` 的可接受值。

  • #20112: 构建：signal：不要与 Cython 一起安装 Pythran 源...

  • #20119: 修复文档字符串中的小问题

  • #20121: 构建：meson.build 文件中的简化

  • #20122: 维护：将 Boost.Math 更新到 1.83.0

  • #20123: 维护：stats：修复 `kendalltau_seasonal` 中的测试失败

  • #20130: 错误：在 orthogonal_eval.pxd 中使用复数 hyp2f1 的 Cython 实现

  • #20135: 维护：interpolate：将 `F_INT` 定义为 `int` 而不是 `npy_int32`

  • #20138: 测试：optimize：在调用 disp=True 的 cobyla 时消除输出

  • #20141: 维护/CI：special/数组类型：在 CI 中测试替代后端

  • #20143: 文档：stats：修复 Kstwobign 分布文档中的错别字

  • #20144: 维护，增强：Hausdorff 简化

  • #20145: 测试：special：为新的 `cdftnc` 回归测试提高容差

  • #20146: 维护：修复 Cython 函数中不正确的 `noexcept` 用法

  • #20149: 构建：确保在系统头文件之前包含 Python.h。

  • #20153: 构建：interpolate：_interpnd_info 不需要安装

  • #20154: 增强：sparse：为 _dok_base 实现 fromkeys

  • #20163: 维护：dev.py：允许在 – 之后使用 –args

  • #20168: 错误：optimize：修复 nnls 内循环中的约束条件

  • #20172: 维护：（附加）数组复制语义垫片

  • #20173: 测试：special：为 nrdtrimn 和 nrdtrisd 添加部分测试

  • #20174: 文档：interpolate：`splrep` 默认边界条件

  • #20175: 维护：sparse：向 DOK 添加缺失的 dict 方法和测试

  • #20176: 维护：vulture/ruff 修复

  • #20181: 维护：避免 `descr->elsize` 并将其用于 intp。

  • #20183: 错误：修复混合压缩稀疏数组上的花式索引...

  • #20184: 文档，DX：删除最新版本中的版本警告横幅

  • #20186: 维护：更新 action。关闭 #20180

  • #20191: 错误：修复提升到 0 或 1 次幂的单个旋转的形状

  • #20193: 维护：更新 `npy2_compat.h` 并添加临时的 pybind11 解决方法

  • #20195: 增强：linalg：允许 expm 等中的只读数组

  • #20197: 测试：linalg：修复 test_bad_geneig 中的复数排序

  • #20198: 构建：将最低 Cython 版本更新到 3.0.8

  • #20203: 测试：linalg：取消 xfail TestEig::test_singular

  • #20204: 测试：linalg：为 gen eig 问题添加回归测试

  • #20205: 修复：修复 `ShortTimeFFT` 中的 `fftshift()`。

  • #20206: 文档：阐明 linalg.qr 中 p 的作用。

  • #20209: CI：将常规 macosx_arm64 从 cirrus 迁移到 GHA

  • #20210: BLD：在 GHA 而非 cirrus 上构建 macosx_arm64 轮子包

  • #20212: 错误修复：linalg/sqrtm：对实数->复数 Schur 分解进行更健壮的检查…

  • #20215: MAINT：以“旧方式”提升 OpenBLAS 版本

  • #20217: 文档/维护：为 nctdtridf、nctdtrinc、nctdtrit 添加示例

  • #20218: 测试：将 linalg.sqrtm 测试标记为 xfail

  • #20221: 测试：调整容差并忽略警告，以获得更可靠的 SVD 测试

  • #20222: 文档：向 stats.CensoredData 添加似然公式

  • #20224: 错误修复：修复使用 minit=’++’ 处理 1D 数据的 `cluster.vq.kmeans2`

  • #20227: 维护：删除重复的 “the” 错误

  • #20229: 错误修复：linalg：修复 Cholesky (potrf) 中的整数溢出

  • #20231: 文档/DX：数组类型：更新 `_asarray` 描述

  • #20232: BLD：重构 BLAS/LAPACK 包装器基础设施

  • #20233: 文档：stats.rv_continuous.fit：修复反斜杠

  • #20235: 文档：在 scipy.stats 中添加 ARGUS 分布的参考

  • #20236: 文档：修复数组 API 文档中的小错误

  • #20237: 维护：optimize：更新 `_direct` 以修正错误

  • #20238: 维护：还原来自 #20227 的 ARPACK 更改

  • #20241: BLD：删除对 `NPY_VISIBILITY_HIDDEN` 的使用

  • #20243: 维护：Specfun 翻译成 C++

  • #20245: 维护：更新了 _specfun.pyx

  • #20248: 维护：删除 specfun_lib 并更新 specfun_wrappers

  • #20250: 维护：interpolate：使用 const 限定 cython 数组

  • #20251: 维护：special：调整 cdflib 的 inf 值

  • #20254: 维护：linalg：重构 Riccati 方程求解器测试以提高可读性

  • #20259: 错误修复：linalg：修复大型数组的 `expm`

  • #20261: 错误修复：linalg：删除 expm 中的 2x2 分支

  • #20263: 文档/发布：将遗漏的过期弃用添加到 1.12.0 说明

  • #20266: 维护：stats.wilcoxon：将 `PermutationMethod` 选项传递给…

  • #20270: BLD：更新 1.13.0 版本和 numpy 2.0 的依赖项

  • #20279: 维护：1.13.0rc1 准备 [轮子包构建]

  • #20290: 发布：将 1.13.0rc2 设置为未发布

  • #20299: 错误修复：Optimize：NewtonCG 在 xtol=0 时崩溃

  • #20313: 维护：更新 pocketfft，MacOS 补丁

  • #20314: 错误修复：sparse：将随机坐标排序恢复到 1.12 之前的状态

  • #20318: 错误修复：signal：修复 signal.lfilter 的标量输入问题

  • #20327: 文档：在 1.13.0 发行说明中提及 BSpline.insert_knot

  • #20333: 错误修复：再次同步 pocketfft

  • #20337: 维护：spatial：在 spatial/_qhull.pyx 中使用 cython_lapack

  • #20341: 错误修复：linalg：在 dnrm2(…, incx<0) 中引发错误

  • #20345: 错误修复：nelder-mead 修复退化单纯形

  • #20347: BLD：要求 pybind11 >=2.12.0 以兼容 numpy 2.0

  • #20349: 避免在 VT.size > INT_MAX 时在 svd(a) 中出现段错误

  • #20350: 错误修复：optimize：修复检查无效优化的错误条件…

  • #20353: 文档：删除过时的 NumPy 导入说明

  • #20359: 增强：将 amos 转换为 std::complex

  • #20361: 增强：其余 amos 转换

  • #20362: 维护，错误修复：更新 OpenBLAS

  • #20364: 错误修复：interpolate：修复 `interpolate.RBFInterpolator` 中 degree=-1 时的错误警告消息

  • #20374: 维护：更新 pybind11 和 numpy 的构建时要求，以兼容…

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