lobpcg#
- scipy.sparse.linalg.lobpcg(A, X, B=None, M=None, Y=None, tol=None, maxiter=None, largest=True, verbosityLevel=0, retLambdaHistory=False, retResidualNormsHistory=False, restartControl=20)[源代码]#
局部最优块预处理共轭梯度法 (LOBPCG)。
LOBPCG 是一个预处理的特征值求解器,用于大型实对称和复 Hermitian 定广义特征值问题。
- 参数:
- A{稀疏矩阵, ndarray, LinearOperator, 可调用对象}
问题的 Hermitian 线性算子,通常由稀疏矩阵给出。通常称为“刚度矩阵”。
- Xndarray, float32 或 float64
初始近似于
k
个特征向量(非稀疏)。如果 A 的shape=(n,n)
,则 X 必须具有shape=(n,k)
。- B{稀疏矩阵, ndarray, LinearOperator, 可调用对象}
可选。默认情况下
B = None
,等价于单位矩阵。广义特征值问题中的右手边算子(如果存在)。通常称为“质量矩阵”。必须是 Hermitian 正定矩阵。- M{稀疏矩阵, ndarray, LinearOperator, 可调用对象}
可选。默认情况下
M = None
,等价于单位矩阵。旨在加速收敛的预处理器。- Yndarray, float32 或 float64,默认值:None
一个
n-by-sizeY
的 ndarray,其中包含约束条件,sizeY < n
。迭代将在 Y 的列空间的B
-正交补集中执行。如果存在 Y,则必须满秩。- tol标量,可选
默认值为
tol=n*sqrt(eps)
。求解器停止准则的容差。- maxiterint,默认值:20
最大迭代次数。
- largestbool,默认值:True
如果为 True,则求解最大的特征值,否则求解最小的特征值。
- verbosityLevelint,可选
默认情况下
verbosityLevel=0
,无输出。控制求解器的标准/屏幕输出。- retLambdaHistorybool,默认值:False
是否返回迭代特征值历史记录。
- retResidualNormsHistorybool,默认值:False
是否返回残差范数的迭代历史记录。
- restartControlint,可选。
如果残差跳跃到
retResidualNormsHistory
中记录的最小值的2**restartControl
倍,则迭代重新开始。默认值为restartControl=20
,为了向后兼容性,重新启动很少发生。
- 返回:
- lambda形状为
(k, )
的 ndarray。 k
个近似特征值的数组。- v与
X.shape
相同形状的 ndarray。 k
个近似特征向量的数组。- lambdaHistoryndarray,可选。
特征值历史记录,如果 retLambdaHistory 为
True
。- ResidualNormsHistoryndarray,可选。
残差范数的历史记录,如果 retResidualNormsHistory 为
True
。
- lambda形状为
注释
迭代循环最多运行
maxit=maxiter
次(如果maxit=None
则为 20),如果满足容差则提前结束。与以前的版本向后不兼容,LOBPCG 现在返回具有最佳精度的迭代向量块,而不是最后一次迭代的向量块,以解决可能出现的发散问题。如果
X.dtype == np.float32
且用户提供的由 A、B 和 M 进行的运算/乘法都保留np.float32
数据类型,则所有计算和输出都在np.float32
中。迭代历史记录输出的大小等于最佳迭代次数(受 maxit 限制)加 3:初始、最终和后处理。
如果 retLambdaHistory 和 retResidualNormsHistory 均为
True
,则返回的元组的格式如下(lambda, V, lambda 历史记录, 残差 范数 历史记录)
。在下文中,
n
表示矩阵大小,k
表示所需的特征值数量(最小或最大)。LOBPCG 代码在每次迭代时通过调用密集特征值求解器 eigh 在内部求解大小为
3k
的特征值问题,因此如果k
相对于n
不够小,则调用 LOBPCG 代码是没有意义的。此外,如果一个人调用 LOBPCG 算法求解5k > n
,则很可能会在内部中断,因此代码会调用标准函数 eigh。不是说n
应该很大 LOBPCG 才能工作,而是n / k
的比率应该很大。如果您使用k=1
和n=10
调用 LOBPCG,它可以工作,尽管n
很小。该方法适用于极大的n / k
。收敛速度基本上取决于三个因素
寻找特征向量的初始近似 X 的质量。如果没有更好的选择,则随机分布在原点周围的向量效果很好。
所需特征值与其余特征值的相对分离。可以改变
k
以改善分离。适当的预处理以缩小谱展。例如,杆振动测试问题(在 tests 目录中)对于较大的
n
来说是病态的,因此收敛速度会很慢,除非使用有效的预处理。对于这个特定问题,一个好的简单预处理器函数是 A 的线性求解,这很容易编码,因为 A 是三对角矩阵。
参考文献
[1]A. V. Knyazev (2001),迈向最佳预处理特征值求解器:局部最优块预处理共轭梯度法。SIAM Journal on Scientific Computing 23, no. 2, pp. 517-541. DOI:10.1137/S1064827500366124
[2]A. V. Knyazev, I. Lashuk, M. E. Argentati, and E. Ovchinnikov (2007),hypre 和 PETSc 中的块局部最优预处理特征值求解器 (BLOPEX)。arXiv:0705.2626
[3]A. V. Knyazev 的 C 和 MATLAB 实现:lobpcg/blopex
示例
我们的第一个例子是最小的 - 通过求解非广义特征值问题
A x = lambda x
,在没有约束或预处理的情况下找到对角矩阵的最大特征值。>>> import numpy as np >>> from scipy.sparse import diags_array >>> from scipy.sparse.linalg import LinearOperator, aslinearoperator >>> from scipy.sparse.linalg import lobpcg
方阵的大小为
>>> n = 100
其对角线项为 1, …, 100,由以下定义
>>> vals = np.arange(1, n + 1).astype(np.int16)
此测试中的第一个强制输入参数是特征值问题
A x = lambda x
的稀疏对角矩阵 A,以求解。>>> A = diags_array(vals, offsets=0, shape=(n, n)) >>> A = A.astype(np.int16) >>> A.toarray() array([[ 1, 0, 0, ..., 0, 0, 0], [ 0, 2, 0, ..., 0, 0, 0], [ 0, 0, 3, ..., 0, 0, 0], ..., [ 0, 0, 0, ..., 98, 0, 0], [ 0, 0, 0, ..., 0, 99, 0], [ 0, 0, 0, ..., 0, 0, 100]], shape=(100, 100), dtype=int16)
第二个强制输入参数 X 是一个 2D 数组,其行维度确定请求的特征值数量。X 是目标特征向量的初始猜测。X 必须具有线性独立的列。如果没有可用的初始近似值,则随机定向的向量通常效果最佳,例如,其分量通常围绕零分布或均匀分布在区间 [-1 1] 上。将初始近似值设置为 dtype
np.float32
会强制所有迭代值都为 dtypenp.float32
,从而加快运行速度,同时仍允许精确的特征值计算。>>> k = 1 >>> rng = np.random.default_rng() >>> X = rng.normal(size=(n, k)) >>> X = X.astype(np.float32)
>>> eigenvalues, _ = lobpcg(A, X, maxiter=60) >>> eigenvalues array([100.], dtype=float32)
lobpcg
只需要访问与 A 的矩阵乘积,而不是矩阵本身。由于矩阵 A 在此示例中是对角线的,因此可以使用对角线值vals
仅编写矩阵乘积A @ X
的函数,例如,通过与 lambda 函数中的广播按元素乘法>>> A_lambda = lambda X: vals[:, np.newaxis] * X
或常规函数
>>> def A_matmat(X): ... return vals[:, np.newaxis] * X
并使用指向这些可调用对象之一的句柄作为输入
>>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_lambda, X, maxiter=60) >>> eigenvalues array([100.], dtype=float32) >>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_matmat, X, maxiter=60) >>> eigenvalues array([100.], dtype=float32)
传统的 callable
LinearOperator
不再必要,但仍然支持作为lobpcg
的输入。显式指定matmat=A_matmat
可以提高性能。>>> A_lo = LinearOperator((n, n), matvec=A_matmat, matmat=A_matmat, dtype=np.int16) >>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_lo, X, maxiter=80) >>> eigenvalues array([100.], dtype=float32)
效率最低的 callable 选项是
aslinearoperator
>>> eigenvalues, _ = lobpcg(aslinearoperator(A), X, maxiter=80) >>> eigenvalues array([100.], dtype=float32)
我们现在切换到计算三个最小的特征值,指定
>>> k = 3 >>> X = np.random.default_rng().normal(size=(n, k))
和
largest=False
参数>>> eigenvalues, _ = lobpcg(A, X, largest=False, maxiter=90) >>> print(eigenvalues) [1. 2. 3.]
下一个示例说明了计算由函数句柄
A_matmat
给出的相同矩阵 A 的 3 个最小特征值,但具有约束和预处理。约束 - 可选的输入参数是一个 2D 数组,由特征向量必须正交的列向量组成
>>> Y = np.eye(n, 3)
在此示例中,预处理器充当 A 的逆,但在降低的精度
np.float32
中,即使初始 X 以及所有迭代和输出都在完整np.float64
中。>>> inv_vals = 1./vals >>> inv_vals = inv_vals.astype(np.float32) >>> M = lambda X: inv_vals[:, np.newaxis] * X
现在让我们先求解没有预处理的矩阵 A 的特征值问题,请求 80 次迭代
>>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_matmat, X, Y=Y, largest=False, maxiter=80) >>> eigenvalues array([4., 5., 6.]) >>> eigenvalues.dtype dtype('float64')
通过预处理,我们只需要来自相同 X 的 20 次迭代
>>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_matmat, X, Y=Y, M=M, largest=False, maxiter=20) >>> eigenvalues array([4., 5., 6.])
请注意,在 Y 中传递的向量是 3 个最小特征值的特征向量。上面返回的结果与这些向量正交。
主矩阵 A 可能是不确定的,例如,在将
vals
从 1, …, 100 移动 50 到 -49, …, 50 之后,我们仍然可以计算 3 个最小或最大的特征值。>>> vals = vals - 50 >>> X = rng.normal(size=(n, k)) >>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_matmat, X, largest=False, maxiter=99) >>> eigenvalues array([-49., -48., -47.]) >>> eigenvalues, _ = lobpcg(A_matmat, X, largest=True, maxiter=99) >>> eigenvalues array([50., 49., 48.])