scipy.stats.sampling.

TransformedDensityRejection#

class scipy.stats.sampling.TransformedDensityRejection(dist, *, mode=None, center=None, domain=None, c=-0.5, construction_points=30, use_dars=True, max_squeeze_hat_ratio=0.99, random_state=None)#

转换密度拒绝法 (TDR)。

TDR 是一种接受/拒绝方法,它利用转换密度函数的凹性来构建帽子函数并自动压缩。与专门针对特定分布的算法相比,大多数通用算法速度非常慢。速度较快的算法设置速度慢,需要大型表格。这种通用方法旨在提供一种速度不至于太慢且仅需少量设置的算法。该方法适用于具有 T 凹密度函数的单变量和单峰连续分布。有关更多详细信息,请参阅 [1][2]

参数:
dist对象

具有 pdfdpdf 方法的类的实例。

  • pdf:分布的 PDF。PDF 的签名应为:def pdf(self, x: float) -> float。即 PDF 应接受 Python 浮点数并返回 Python 浮点数。它不需要积分到 1,即 PDF 不需要归一化。

  • dpdf:PDF 关于 x(即变量)的导数。必须与 PDF 具有相同的签名。

modefloat,可选

分布的(精确)众数。默认为 None

centerfloat,可选

众数或分布平均值的近似位置。此位置提供了有关 PDF 主要部分的一些信息,并用于避免数值问题。默认为 None

domain长度为 2 的列表或元组,可选

分布的支持。默认为 None。当 None

  • 如果分布对象 dist 提供了 support 方法,则使用它来设置分布的域。

  • 否则,假设支持为 \((-\infty, \infty)\).

c{ -0.5, 0. },可选

为变换函数 T 设置参数 c。默认为 -0.5。PDF 的变换必须是凹的,才能构建帽子函数。这种 PDF 被称为 T 凹函数。目前,支持以下变换

\[\begin{split}c = 0.: T(x) &= \log(x)\\ c = -0.5: T(x) &= \frac{1}{\sqrt{x}} \text{ (默认)}\end{split}\]
construction_pointsint 或 array_like,可选

如果为整数,则定义构造点的数量。如果为 array_like,则使用数组的元素作为构造点。默认为 30。

use_darsbool,可选

如果为 True,则在设置时使用“去随机化自适应拒绝采样”(DARS)。有关 DARS 算法的详细信息,请参阅 [1]

max_squeeze_hat_ratiofloat,可选

为比率(压缩下方区域)/(帽子下方区域)设置上限。它必须是 0 到 1 之间的数字。默认为 0.99。

random_state{ None, int, numpy.random.Generator,

NumPy 随机数生成器或用于生成均匀随机数流的底层 NumPy 随机数生成器的种子。如果 random_state 为 None(或 np.random),则使用 numpy.random.RandomState 单例。如果 random_state 为 int,则使用新的 RandomState 实例,并使用 random_state 为其播种。如果 random_state 已经是 GeneratorRandomState 实例,则使用该实例。

参考文献

[1] (1,2)

UNU.RAN 参考手册,第 5.3.16 节,“TDR - 转换密度拒绝法”,http://statmath.wu.ac.at/software/unuran/doc/unuran.html#TDR

[2]

Hörmann, Wolfgang。 “从 T 凹分布中采样的拒绝技术。” ACM 数学软件汇刊 (TOMS) 21.2 (1995):182-193

[3]

W.R. Gilks 和 P. Wild (1992)。用于 Gibbs 采样的自适应拒绝采样,应用统计 41,第 337-348 页。

示例

>>> from scipy.stats.sampling import TransformedDensityRejection
>>> import numpy as np

假设我们有一个密度函数

\[\begin{split}f(x) = \begin{cases} 1 - x^2, & -1 \leq x \leq 1 \\ 0, & \text{otherwise} \end{cases}\end{split}\]

此密度函数的导数为

\[\begin{split}\frac{df(x)}{dx} = \begin{cases} -2x, & -1 \leq x \leq 1 \\ 0, & \text{otherwise} \end{cases}\end{split}\]

请注意,PDF 不积分到 1。由于这是一种基于拒绝的方法,因此我们不需要归一化 PDF。为了初始化生成器,我们可以使用

>>> urng = np.random.default_rng()
>>> class MyDist:
...     def pdf(self, x):
...         return 1-x*x
...     def dpdf(self, x):
...         return -2*x
...
>>> dist = MyDist()
>>> rng = TransformedDensityRejection(dist, domain=(-1, 1),
...                                   random_state=urng)

域对于截断分布非常有用,但为了避免每次都将其传递给构造函数,可以通过在分布对象 (dist) 中提供 support 方法来设置默认域

>>> class MyDist:
...     def pdf(self, x):
...         return 1-x*x
...     def dpdf(self, x):
...         return -2*x
...     def support(self):
...         return (-1, 1)
...
>>> dist = MyDist()
>>> rng = TransformedDensityRejection(dist, random_state=urng)

现在,我们可以使用 rvs 方法从分布中生成样本

>>> rvs = rng.rvs(1000)

我们可以通过可视化其直方图来检查样本是否来自给定的分布

>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>> x = np.linspace(-1, 1, 1000)
>>> fx = 3/4 * dist.pdf(x)  # 3/4 is the normalizing constant
>>> plt.plot(x, fx, 'r-', lw=2, label='true distribution')
>>> plt.hist(rvs, bins=20, density=True, alpha=0.8, label='random variates')
>>> plt.xlabel('x')
>>> plt.ylabel('PDF(x)')
>>> plt.title('Transformed Density Rejection Samples')
>>> plt.legend()
>>> plt.show()
../../_images/scipy-stats-sampling-TransformedDensityRejection-1.png
属性:
hat_area

获取生成器帽子下方区域。

squeeze_area

获取生成器压缩下方区域。

squeeze_hat_ratio

获取生成器当前比率(压缩下方区域)/(帽子下方区域)。

方法

ppf_hat(u)

u 处评估帽子分布 CDF 的逆函数。

rvs([size, random_state])

从分布中采样。

set_random_state([random_state])

设置底层均匀随机数生成器。