quadratic_assignment#
- scipy.optimize.quadratic_assignment(A, B, method='faq', options=None)[source]#
逼近求解二次分配问题和图匹配问题。
二次分配问题求解下列形式的问题:
\[\begin{split}\min_P & \ {\ \text{trace}(A^T P B P^T)}\\ \mbox{s.t. } & {P \ \epsilon \ \mathcal{P}}\\\end{split}\]其中 \(\mathcal{P}\) 是所有排列矩阵集合,\(A\) 和 \(B\) 是方阵。
图匹配问题试图最大化同一个目标函数。该算法可以被理解为寻找两个图的节点匹配,它使导致的边不同数目最小化,或者在加权图的情况下,权重的平方和差最小化。
请注意二次分配问题是 NP-hard 问题。此处给出的结果是逼近结果,无法保证是最优解。
- 参数:
- A2-D 数组,方阵
上面的目标函数中的方阵 \(A\)。
- B2-D 数组,方阵
上面目标函数中的方阵 \(B\)。
- methodstr in {‘faq’, ‘2opt’}(默认值:"faq")
- options字典,可选
求解器选项词典。所有求解器都支持以下操作:
- maximize布尔值(默认值:False)
如果
True
,则使目标函数最大化。- partial_match2-D 整数数组,可选(默认值:None)
修复匹配的一部分。这也称为“种子”[2]。
partial_match 的每一行都指定一个匹配节点对:A 节点
partial_match[i, 0]
匹配到 B 节点partial_match[i, 1]
。数组的形状为(m, 2)
,其中m
不应大于节点数\(n\)。- rng{None, int,
numpy.random.Generator
, 如果seed 为 None(或np.random),则会使用
numpy.random.RandomState
单例。如果seed 为一个整数,则会使用一个新的RandomState
实例,并使用seed 进行填充。如果seed 已经是一个Generator
或RandomState
实例,那么就会使用该实例。
有关方法特定选项,请参阅
show_options('quadratic_assignment')
。
- 返回:
- res优化结果
优化结果
,其中包含以下字段。- col_ind一维数组
B 节点的最佳顺序对应的列指标。
- funfloat
解决方案的目标值。
- nitint
优化过程中执行的迭代次数。
注意
默认方法 ‘faq’ 使用快速近似 QP 算法 [1];它通常提供速度和准确度的最佳组合。方法 ‘2opt’ 计算成本可能高,但可能是一种有用的备选方案,或者可用于优化其他方法返回的解决方案。
参考
[1]J.T. Vogelstein、J.M. Conroy、V. Lyzinski、L.J. Podrazik、S.G. Kratzer、E.T. Harley、D.E. Fishkind、R.J. Vogelstein 和 C.E. Priebe,“用于图匹配的快速近似二次规划”,PLOS one,卷 10,第 4 期,e0121002,2015,DOI:10.1371/journal.pone.0121002
[2]D. Fishkind、S. Adali、H. Patsolic、L. Meng、D. Singh、V. Lyzinski、C. Priebe,“种子图匹配”,Pattern Recognit. 87 (2019):203-215,DOI:10.1016/j.patcog.2018.09.014
[3]“2-opt”,维基百科。https://en.wikipedia.org/wiki/2-opt
示例
>>> import numpy as np >>> from scipy.optimize import quadratic_assignment >>> A = np.array([[0, 80, 150, 170], [80, 0, 130, 100], ... [150, 130, 0, 120], [170, 100, 120, 0]]) >>> B = np.array([[0, 5, 2, 7], [0, 0, 3, 8], ... [0, 0, 0, 3], [0, 0, 0, 0]]) >>> res = quadratic_assignment(A, B) >>> print(res) fun: 3260 col_ind: [0 3 2 1] nit: 9
要了解返回的
col_ind
和fun
之间的关系,请使用col_ind
形成找到的最佳排列矩阵,然后评估目标函数 \(f(P) = trace(A^T P B P^T )\)。>>> perm = res['col_ind'] >>> P = np.eye(len(A), dtype=int)[perm] >>> fun = np.trace(A.T @ P @ B @ P.T) >>> print(fun) 3260
或者,为避免明确构建排列矩阵,直接列出距离矩阵的行和列。
>>> fun = np.trace(A.T @ B[perm][:, perm]) >>> print(fun) 3260
虽然通常无法保证,但碰巧可以找到
quadratic_assignment
的全局最优解。>>> from itertools import permutations >>> perm_opt, fun_opt = None, np.inf >>> for perm in permutations([0, 1, 2, 3]): ... perm = np.array(perm) ... fun = np.trace(A.T @ B[perm][:, perm]) ... if fun < fun_opt: ... fun_opt, perm_opt = fun, perm >>> print(np.array_equal(perm_opt, res['col_ind'])) True
这是一个默认方法 ‘faq’ 找不到全局最优值的示例。
>>> A = np.array([[0, 5, 8, 6], [5, 0, 5, 1], ... [8, 5, 0, 2], [6, 1, 2, 0]]) >>> B = np.array([[0, 1, 8, 4], [1, 0, 5, 2], ... [8, 5, 0, 5], [4, 2, 5, 0]]) >>> res = quadratic_assignment(A, B) >>> print(res) fun: 178 col_ind: [1 0 3 2] nit: 13
如果准确性很重要,请考虑使用 ‘2opt’ 来优化解决方案。
>>> guess = np.array([np.arange(len(A)), res.col_ind]).T >>> res = quadratic_assignment(A, B, method="2opt", ... options = {'partial_guess': guess}) >>> print(res) fun: 176 col_ind: [1 2 3 0] nit: 17