DiscreteAliasUrn#
- 类 scipy.stats.sampling.DiscreteAliasUrn(dist, *, domain=None, urn_factor=1, random_state=None)#
离散别名瓮法。
此方法用于针对具有有限域的单变量离散分布进行抽样。它使用大小为 \(N\) 的概率向量或具有有限支持的概率质量函数从分布中生成随机数。
- 参数:
- distarray_like 或对象,可选
分布的概率向量 (PV)。如果没有 PV,则需要带有
pmf
方法的类的实例。PMF 的签名应为:def pmf(self, k: int) -> float
”。换言之,它应接受 Python 整数并返回 Python 浮点数。- domainint,可选
PMF 的支持。如果无概率向量 (
pv
),则必须给出有限的域。即,PMF 必须具有有限的支持。默认值为None
。当为None
如果分发对象 dist 提供了
support
方法,则使用该方法设置分发区域。否则,假设支持为
(0, len(pv))
。当此参数与概率向量组合传递时,domain[0]
用于将分布从(0, len(pv))
重新定位到(domain[0], domain[0]+len(pv))
,而domain[1]
被忽略。请参阅注释和教程以获得更详细的说明。
- urn_factorfloat,可选
相对于概率向量大小的 urn 表大小。它不能小于 1。较大的表格会导致更快的生成时间,但需要更昂贵的设置。默认值为 1。
- random_state{None、int、
numpy.random.Generator
} 用于生成均匀随机数流的 NumPy 随机数生成器或底层 NumPy 随机数生成器的种子。如果 random_state 为 None(或 np.random),则使用
numpy.random.RandomState
单例。如果 random_state 为 int,则使用新的RandomState
实例,并使用 random_state 播种。如果 random_state 已是Generator
或RandomState
实例,则使用该实例。
注释
在以下情况下,此方法有效:有有限概率向量可用,或有分布的 PMF 可用。只在有 PMF 可用时,必须给定 PMF 的有限支持(区域)。建议先在支持中的每个点处评估 PMF 来获取概率向量,然后再使用它。
如果给定了概率向量,则概率向量一定是没有任何
inf
或nan
值的非负浮点数一维数组。而且,至少必须有一个非零条目,否则将引发异常。默认情况下,从 0 开始对概率向量编制索引。但是,可以通过传递
domain
参数来更改此项。当domain
与 PV 一起给出时,就会将分布从(0, len(pv))
重新定位到(domain[0]
,domain[0] + len(pv))
。在这种情况下将忽略domain[1]
。可以增加参数
urn_factor
,以加快生成速度,但会增加设置时间。此方法使用表格进行随机变量生成。urn_factor
控制此表格相对于概率向量大小(或在不可用 PV 时支撑的宽度)的大小。由于此表格是在设置期间计算的,因此增加此参数会线性增加设置所需的时间。建议将此参数保持在 2 以下。参考文献
[1]UNU.RAN 参考手册,第 5.8.2 节,“DAU -(离散)别名壶方法” http://statmath.wu.ac.at/software/unuran/doc/unuran.html#DAU
[2]A.J. Walker(1977)。一种生成具有通用分布的离散随机变量的高效方法,ACM Trans.数学软件 3,第 253-256 页。
例子
>>> from scipy.stats.sampling import DiscreteAliasUrn >>> import numpy as np
要使用概率向量创建随机数生成器,请使用
>>> pv = [0.1, 0.3, 0.6] >>> urng = np.random.default_rng() >>> rng = DiscreteAliasUrn(pv, random_state=urng)
RNG 已设置。现在,我们可以使用
rvs
方法从分布中生成样本>>> rvs = rng.rvs(size=1000)
要验证随机变量是否遵循给定的分布,我们可以使用卡方检验(作为拟合优度的衡量标准)
>>> from scipy.stats import chisquare >>> _, freqs = np.unique(rvs, return_counts=True) >>> freqs = freqs / np.sum(freqs) >>> freqs array([0.092, 0.292, 0.616]) >>> chisquare(freqs, pv).pvalue 0.9993602047563164
由于 p 值非常高,我们无法拒绝观测频率与预期频率相同的原假设。因此,我们可以安全地假设变量已从给定的分布中生成。请注意,这仅表示算法的正确性,并不表示样本的质量。
如果不可用 PV,也可以传递具有 PMF 方法和有限域的类的实例。
>>> urng = np.random.default_rng() >>> class Binomial: ... def __init__(self, n, p): ... self.n = n ... self.p = p ... def pmf(self, x): ... # note that the pmf doesn't need to be normalized. ... return self.p**x * (1-self.p)**(self.n-x) ... def support(self): ... return (0, self.n) ... >>> n, p = 10, 0.2 >>> dist = Binomial(n, p) >>> rng = DiscreteAliasUrn(dist, random_state=urng)
现在,我们可以通过使用
rvs
方法从分布中进行采样,还可以测量样本的拟合优度>>> rvs = rng.rvs(1000) >>> _, freqs = np.unique(rvs, return_counts=True) >>> freqs = freqs / np.sum(freqs) >>> obs_freqs = np.zeros(11) # some frequencies may be zero. >>> obs_freqs[:freqs.size] = freqs >>> pv = [dist.pmf(i) for i in range(0, 11)] >>> pv = np.asarray(pv) / np.sum(pv) >>> chisquare(obs_freqs, pv).pvalue 0.9999999999999999
为了检查样本是否从正确的分布中抽取,我们可以查看样本的直方图
>>> import matplotlib.pyplot as plt >>> rvs = rng.rvs(1000) >>> fig = plt.figure() >>> ax = fig.add_subplot(111) >>> x = np.arange(0, n+1) >>> fx = dist.pmf(x) >>> fx = fx / fx.sum() >>> ax.plot(x, fx, 'bo', label='true distribution') >>> ax.vlines(x, 0, fx, lw=2) >>> ax.hist(rvs, bins=np.r_[x, n+1]-0.5, density=True, alpha=0.5, ... color='r', label='samples') >>> ax.set_xlabel('x') >>> ax.set_ylabel('PMF(x)') >>> ax.set_title('Discrete Alias Urn Samples') >>> plt.legend() >>> plt.show()
要设置
urn_factor
,请使用>>> rng = DiscreteAliasUrn(pv, urn_factor=2, random_state=urng)
这将使用一张表(大小是概率向量的两倍)从分布中生成随机变量。
方法
rvs
([size, random_state])从分布中进行采样。
set_random_state
([random_state])设置基础均匀随机数生成器。