scipy.stats.

quantile_test#

scipy.stats.quantile_test(x, *, q=0, p=0.5, alternative='two-sided')[源代码]#

执行分位数检验并计算分位数的置信区间。

此函数检验零假设:q 是与样本 x 对应的总体概率 p 的分位数的值。例如,使用默认参数,它检验 x 的潜在总体的中位数是否为零。该函数返回一个对象,包括检验统计量、p 值以及用于计算分位数周围置信区间的方法。

参数:
xarray_like

一维样本。

qfloat,默认值:0

假设的分位数的值。

pfloat,默认值:0.5

与分位数相关的概率;即小于 q 的总体比例为 p。必须严格介于 0 和 1 之间。

alternative{‘two-sided’, ‘less’, ‘greater’}, 可选

定义备择假设。以下选项可用(默认值为 ‘two-sided’)

  • ‘two-sided’:与概率 p 相关的分位数不为 q

  • ‘less’:与概率 p 相关的分位数小于 q

  • ‘greater’:与概率 p 相关的分位数大于 q

返回:
resultQuantileTestResult

一个具有以下属性的对象

statisticfloat

分位数检验中可能使用的两个检验统计量之一。第一个检验统计量,T1,是 x 中小于或等于假设分位数 q 的样本比例。第二个检验统计量,T2,是 x 中严格小于假设分位数 q 的样本比例。

alternative = 'greater' 时,T1 用于计算 p 值,并且 statistic 设置为 T1

alternative = 'less' 时,T2 用于计算 p 值,并且 statistic 设置为 T2

alternative = 'two-sided' 时,将考虑 T1T2,并使用导致最小 p 值的那个。

statistic_typeint

值为 12,具体取决于使用 T1 还是 T2 来计算 p 值。

pvaluefloat

与给定备择假设相关的 p 值。

该对象还具有以下方法

confidence_interval(confidence_level=0.95)

计算与概率 p 相关的总体分位数周围的置信区间。置信区间在具有字段 lowhighnamedtuple 中返回。当没有足够的观测值来计算所需置信度的置信区间时,值为 nan

说明

此检验及其计算置信区间的方法是非参数的。当且仅当观测值是 i.i.d. 时,它们才有效。

检验的实现遵循 Conover [1]。考虑了两个检验统计量。

T1x 中小于或等于 q 的观测数。

T1 = (x <= q).sum()

T2x 中严格小于 q 的观测数。

T2 = (x < q).sum()

必须使用两个检验统计量来处理 x 是从离散分布或混合分布中生成的情况。

检验的零假设是

H0:第 \(p^{\mathrm{th}}\) 个总体分位数是 q

每个检验统计量的零分布是 \(\mathrm{binom}\left(n, p\right)\)。当 alternative='less' 时,备择假设为

H1:第 \(p^{\mathrm{th}}\) 个总体分位数小于 q

并且 p 值是二项式随机变量的概率

\[Y \sim \mathrm{binom}\left(n, p\right)\]

大于或等于观测值 T2

alternative='greater' 时,备择假设为

H1:第 \(p^{\mathrm{th}}\) 个总体分位数大于 q

并且 p 值是二项式随机变量 Y 小于或等于观测值 T1 的概率。

alternative='two-sided' 时,备择假设为

H1:q 不是第 \(p^{\mathrm{th}}\) 个总体分位数。

并且 p 值是 'less''greater' 情况的 p 值中较小值的两倍。对于相同的数据,这两个 p 值都可能超过 0.5,因此该值被裁剪到区间 \([0, 1]\) 中。

置信区间的方法归因于 Thompson [2],后来被证明适用于任何 i.i.d. 样本集 [3]。该计算基于以下观察:分位数 \(q\) 大于任何观测值 \(x_m (1\leq m \leq N)\) 的概率可以计算为

\[\mathbb{P}(x_m \leq q) = 1 - \sum_{k=0}^{m-1} \binom{N}{k} q^k(1-q)^{N-k}\]

默认情况下,置信区间的计算置信度为 95%。对 95% 置信区间的常见解释是,如果从同一总体中重复抽取 i.i.d. 样本并每次形成置信区间,则置信区间将在大约 95% 的试验中包含指定分位数的真实值。

QuantileNPCI R 包中提供了类似的功能 [4]。基础是相同的,但它通过在样本值之间进行插值来计算置信区间边界,而此函数仅使用样本值作为边界。因此,quantile_test.confidence_interval 返回的区间更保守(即更大)。

confintr 包中包含了相同的分位数置信区间计算 [5]

不能保证双边置信区间是最优的;也就是说,可能存在一个更紧密的区间,它可能以大于置信度的概率包含感兴趣的分位数。在没有对样本进行进一步假设(例如,潜在分布的性质)的情况下,单边区间是最佳的。

参考文献

[1]
    1. Conover。实用非参数统计,第 3 版,1999 年。

[2]

W. R. Thompson,“关于未知分布形式的总体中位数和其他期望分布的置信范围”,《数理统计年鉴》,第 7 卷,第 3 期,第 122-128 页,1936 年,访问时间:2019 年 9 月 18 日。[在线]。可用:https://www.jstor.org/stable/2957563

[3]

H. A. David 和 H. N. Nagaraja,“非参数推断中的顺序统计量”,载于《顺序统计量》,John Wiley & Sons, Ltd,2005 年,第 159-170 页。可用:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/0471722162.ch7

[4]

N. Hutson、A. Hutson、L. Yan,“QuantileNPCI:分位数的非参数置信区间”,R 包,https://cran.r-project.org.cn/package=QuantileNPCI

[5]

M. Mayer,“confintr:置信区间”,R 包,https://cran.r-project.org.cn/package=confintr

示例

假设我们希望检验总体的中位数等于 0.5 的零假设。我们选择 99% 的置信水平;也就是说,如果 p 值小于 0.01,我们将拒绝零假设,转而支持备择假设。

当测试来自标准均匀分布的随机变量时,该分布的中位数为 0.5,我们预期数据在大多数情况下与零假设一致。

>>> import numpy as np
>>> from scipy import stats
>>> rng = np.random.default_rng()
>>> rvs = stats.uniform.rvs(size=100, random_state=rng)
>>> stats.quantile_test(rvs, q=0.5, p=0.5)
QuantileTestResult(statistic=45, statistic_type=1, pvalue=0.36820161732669576)

正如预期的那样,p 值没有低于我们的阈值 0.01,因此我们无法拒绝零假设。

当测试来自标准正态分布的数据时,该分布的中位数为 0,我们预期会拒绝零假设。

>>> rvs = stats.norm.rvs(size=100, random_state=rng)
>>> stats.quantile_test(rvs, q=0.5, p=0.5)
QuantileTestResult(statistic=67, statistic_type=2, pvalue=0.0008737198369123724)

事实上,p 值低于我们的阈值 0.01,因此我们拒绝零假设,转而支持默认的“双侧”备择假设:总体的中位数等于 0.5。

但是,假设我们要针对单侧备择假设(总体的中位数大于 0.5)来检验零假设。由于标准正态分布的中位数小于 0.5,我们不会预期会拒绝零假设。

>>> stats.quantile_test(rvs, q=0.5, p=0.5, alternative='greater')
QuantileTestResult(statistic=67, statistic_type=1, pvalue=0.9997956114162866)

不出所料,由于 p 值大于我们的阈值,我们不会拒绝零假设,转而支持所选择的备择假设。

分位数检验可以用于任何分位数,而不仅仅是中位数。例如,我们可以测试样本基础分布的第三四分位数是否大于 0.6。

>>> rvs = stats.uniform.rvs(size=100, random_state=rng)
>>> stats.quantile_test(rvs, q=0.6, p=0.75, alternative='greater')
QuantileTestResult(statistic=64, statistic_type=1, pvalue=0.00940696592998271)

p 值低于阈值。我们拒绝零假设,转而支持备择假设:我们样本的基础分布的第三四分位数大于 0.6。

quantile_test 还可以计算任何分位数的置信区间。

>>> rvs = stats.norm.rvs(size=100, random_state=rng)
>>> res = stats.quantile_test(rvs, q=0.6, p=0.75)
>>> ci = res.confidence_interval(confidence_level=0.95)
>>> ci
ConfidenceInterval(low=0.284491604437432, high=0.8912531024914844)

当测试单侧备择假设时,置信区间包含所有观测值,这些观测值在作为 q 传递时,测试的 p 值将大于 0.05,因此不会拒绝零假设。例如

>>> rvs.sort()
>>> q, p, alpha = 0.6, 0.75, 0.95
>>> res = stats.quantile_test(rvs, q=q, p=p, alternative='less')
>>> ci = res.confidence_interval(confidence_level=alpha)
>>> for x in rvs[rvs <= ci.high]:
...     res = stats.quantile_test(rvs, q=x, p=p, alternative='less')
...     assert res.pvalue > 1-alpha
>>> for x in rvs[rvs > ci.high]:
...     res = stats.quantile_test(rvs, q=x, p=p, alternative='less')
...     assert res.pvalue < 1-alpha

此外,如果为随机样本重复生成 95% 的置信区间,则置信区间将在大约 95% 的重复试验中包含真实的分位数。

>>> dist = stats.rayleigh() # our "unknown" distribution
>>> p = 0.2
>>> true_stat = dist.ppf(p) # the true value of the statistic
>>> n_trials = 1000
>>> quantile_ci_contains_true_stat = 0
>>> for i in range(n_trials):
...     data = dist.rvs(size=100, random_state=rng)
...     res = stats.quantile_test(data, p=p)
...     ci = res.confidence_interval(0.95)
...     if ci[0] < true_stat < ci[1]:
...         quantile_ci_contains_true_stat += 1
>>> quantile_ci_contains_true_stat >= 950
True

这适用于任何分布和任何分位数,只要样本是独立同分布的。