心电图#
- scipy.misc.electrocardiogram()[源代码]#
加载心电图作为一维信号的示例。
返回的信号是长达 5 分钟的心电图 (ECG),即以 360 Hz 采样的心脏电活动医疗记录。
自 1.10.0 版本后已弃用:
electrocardiogram
已从 SciPy 1.10.0 中的scipy.misc.electrocardiogram
中弃用,并且将在 SciPy 1.12.0 中彻底移除。数据集方法已移入scipy.datasets
模块。改用scipy.datasets.electrocardiogram
。- 返回::
- ecgndarray
心电图以 360 Hz 采样的毫伏 (mV)。
备注
提供的信号是来自 记录 208(导联 MLII)的摘录(19:35 至 24:35),该记录是由 MIT-BIH 心律失常数据库 [1] 在 PhysioNet [2] 上提供的。摘录包括噪声引起的伪像、典型的心跳以及病理性改变。
在 1.1.0 版本中添加。
参考文献
[1]Moody GB、Mark RG。MIT-BIH 心律失常数据库的影响。IEEE Eng in Med and Biol 20(3):45-50(2001 年 5 月至 6 月)。(PMID: 11446209);DOI:10.13026/C2F305
[2]Goldberger AL、Amaral LAN、Glass L、Hausdorff JM、Ivanov PCh、Mark RG、Mietus JE、Moody GB、Peng C-K、Stanley HE。PhysioBank、PhysioToolkit 和 PhysioNet:复杂生理信号新研究资源的组成部分。Circulation 101(23):e215-e220;DOI:10.1161/01.CIR.101.23.e215
示例
>>> from scipy.misc import electrocardiogram >>> ecg = electrocardiogram() >>> ecg array([-0.245, -0.215, -0.185, ..., -0.405, -0.395, -0.385]) >>> ecg.shape, ecg.mean(), ecg.std() ((108000,), -0.16510875, 0.5992473991177294)
前面已述,该信号有几个不同形态的区域。例如,前几秒显示心音窦性心律的电活动,如下所示。
>>> import numpy as np >>> import matplotlib.pyplot as plt >>> fs = 360 >>> time = np.arange(ecg.size) / fs >>> plt.plot(time, ecg) >>> plt.xlabel("time in s") >>> plt.ylabel("ECG in mV") >>> plt.xlim(9, 10.2) >>> plt.ylim(-1, 1.5) >>> plt.show()
然而,在第 16 秒后,出现了第一批过早性心室收缩,也称为期外收缩。与典型的心跳相比,它们的形态不同。可以在下图中轻松观察到差异。
>>> plt.plot(time, ecg) >>> plt.xlabel("time in s") >>> plt.ylabel("ECG in mV") >>> plt.xlim(46.5, 50) >>> plt.ylim(-2, 1.5) >>> plt.show()
在几个点上,记录会受到严重伪像的影响,例如
>>> plt.plot(time, ecg) >>> plt.xlabel("time in s") >>> plt.ylabel("ECG in mV") >>> plt.xlim(207, 215) >>> plt.ylim(-2, 3.5) >>> plt.show()
最后,检查功率谱显示大多数生物信号由较低频率组成。在 60 Hz 时,可以清楚地观察到受市电影响的噪声。
>>> from scipy.signal import welch >>> f, Pxx = welch(ecg, fs=fs, nperseg=2048, scaling="spectrum") >>> plt.semilogy(f, Pxx) >>> plt.xlabel("Frequency in Hz") >>> plt.ylabel("Power spectrum of the ECG in mV**2") >>> plt.xlim(f[[0, -1]]) >>> plt.show()