心电图#
- scipy.datasets.electrocardiogram()[源代码]#
加载心电图作为一维信号的示例。
返回的信号是 5 分钟长的心电图 (ECG),它是心脏电活动的医学记录,以 360 Hz 的频率采样。
- 返回:
- ecgndarray
以 360 Hz 采样的心电图,单位为毫伏 (mV)。
注意
提供的信号是 MIT-BIH 心律失常数据库 [1] 在 PhysioNet [2] 上提供的 记录 208(导联 MLII)的摘录(19:35 至 24:35)。该摘录包括噪声引起的伪影、典型的心跳以及病理变化。
在 1.1.0 版本中添加。
参考文献
[1]Moody GB, Mark RG. The impact of the MIT-BIH Arrhythmia Database. IEEE Eng in Med and Biol 20(3):45-50 (May-June 2001). (PMID: 11446209); DOI:10.13026/C2F305
[2]Goldberger AL, Amaral LAN, Glass L, Hausdorff JM, Ivanov PCh, Mark RG, Mietus JE, Moody GB, Peng C-K, Stanley HE. PhysioBank, PhysioToolkit, and PhysioNet: Components of a New Research Resource for Complex Physiologic Signals. Circulation 101(23):e215-e220; DOI:10.1161/01.CIR.101.23.e215
示例
>>> from scipy.datasets import electrocardiogram >>> ecg = electrocardiogram() >>> ecg array([-0.245, -0.215, -0.185, ..., -0.405, -0.395, -0.385], shape=(108000,)) >>> ecg.shape, ecg.mean(), ecg.std() ((108000,), -0.16510875, 0.5992473991177294)
如前所述,该信号具有几个不同形态的区域。例如,前几秒钟显示了如下所示的正常窦性节律心脏的电活动。
>>> import numpy as np >>> import matplotlib.pyplot as plt >>> fs = 360 >>> time = np.arange(ecg.size) / fs >>> plt.plot(time, ecg) >>> plt.xlabel("time in s") >>> plt.ylabel("ECG in mV") >>> plt.xlim(9, 10.2) >>> plt.ylim(-1, 1.5) >>> plt.show()
然而,在第 16 秒之后,出现了第一个室性早搏,也称为期外收缩。与典型的心跳相比,这些具有不同的形态。在下面的图中可以很容易地观察到差异。
>>> plt.plot(time, ecg) >>> plt.xlabel("time in s") >>> plt.ylabel("ECG in mV") >>> plt.xlim(46.5, 50) >>> plt.ylim(-2, 1.5) >>> plt.show()
在几个点,大的伪影扰乱了记录,例如。
>>> plt.plot(time, ecg) >>> plt.xlabel("time in s") >>> plt.ylabel("ECG in mV") >>> plt.xlim(207, 215) >>> plt.ylim(-2, 3.5) >>> plt.show()
最后,检查功率谱显示,大部分生物信号由较低频率组成。在 60 Hz 处,可以清楚地观察到由市电引起的噪声。
>>> from scipy.signal import welch >>> f, Pxx = welch(ecg, fs=fs, nperseg=2048, scaling="spectrum") >>> plt.semilogy(f, Pxx) >>> plt.xlabel("Frequency in Hz") >>> plt.ylabel("Power spectrum of the ECG in mV**2") >>> plt.xlim(f[[0, -1]]) >>> plt.show()