在规则网格上进行多元数据插值 (RegularGridInterpolator
)#
假设您在规则网格上拥有 N 维数据,并且您想对其进行插值。在这种情况下,RegularGridInterpolator
可能会有用。支持几种插值策略:最近邻、线性以及奇数次张量积样条。
严格来说,此类可以有效地处理在直线网格上给出的数据:超立方格,其点之间可能具有不同的间距。不同维度上的点数可以不同。
以下示例演示了它的用法,并比较了使用每种方法的插值结果。
>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>> from scipy.interpolate import RegularGridInterpolator
假设我们想插值这个 2 维函数。
>>> def F(u, v):
... return u * np.cos(u * v) + v * np.sin(u * v)
假设我们只知道规则网格上的一些数据。
>>> fit_points = [np.linspace(0, 3, 8), np.linspace(0, 3, 11)]
>>> values = F(*np.meshgrid(*fit_points, indexing='ij'))
创建用于评估的测试点和真实值。
>>> ut, vt = np.meshgrid(np.linspace(0, 3, 80), np.linspace(0, 3, 80), indexing='ij')
>>> true_values = F(ut, vt)
>>> test_points = np.array([ut.ravel(), vt.ravel()]).T
我们可以创建插值器并使用每种方法对测试点进行插值。
>>> interp = RegularGridInterpolator(fit_points, values)
>>> fig, axes = plt.subplots(2, 3, figsize=(10, 6))
>>> axes = axes.ravel()
>>> fig_index = 0
>>> for method in ['linear', 'nearest', 'slinear', 'cubic', 'quintic']:
... im = interp(test_points, method=method).reshape(80, 80)
... axes[fig_index].imshow(im)
... axes[fig_index].set_title(method)
... axes[fig_index].axis("off")
... fig_index += 1
>>> axes[fig_index].imshow(true_values)
>>> axes[fig_index].set_title("True values")
>>> fig.tight_layout()
>>> fig.show()
正如预期的那样,更高阶样条插值最接近真实值,尽管计算成本比使用线性或最近邻更高。slinear 插值也与线性插值匹配。

如果您的数据使得样条方法产生振铃,您可以考虑使用method=”pchip”,它使用 PCHIP 插值器的张量积,每个维度一个PchipInterpolator
。
如果您更喜欢函数式接口而不是显式创建类实例,则interpn
辅助函数提供了等效的功能。
具体来说,这两种形式给出相同的结果
>>> from scipy.interpolate import interpn
>>> rgi = RegularGridInterpolator(fit_points, values)
>>> result_rgi = rgi(test_points)
和
>>> result_interpn = interpn(fit_points, values, test_points)
>>> np.allclose(result_rgi, result_interpn, atol=1e-15)
True
对于限制在 N 维空间的 (N-1) 维子空间中的数据,即当其中一个网格轴的长度为 1 时,沿该轴的插值由 fill_value
关键字参数控制。
>>> x = np.array([0, 5, 10])
>>> y = np.array([0])
>>> data = np.array([[0], [5], [10]])
>>> rgi = RegularGridInterpolator((x, y), data,
... bounds_error=False, fill_value=None)
>>> rgi([(2, 0), (2, 1), (2, -1)])
array([2., 2., 2.])) # extrapolate the value on the axis
>>> rgi.fill_value = -101
>>> rgi([(2, 0), (2, 1), (2, -1)])
array([2., -101., -101.]))
注意
如果输入数据使得输入维度具有不相称的单位并且相差很多数量级,则插值器可能具有数值伪影。考虑在插值之前重新缩放数据。
均匀间隔数据#
如果您正在处理具有整数坐标的笛卡尔网格上的数据,例如重采样图像数据,这些例程可能不是最佳选择。考虑使用 scipy.ndimage.map_coordinates
。
对于具有等间距的网格上的浮点数据,map_coordinates
可以轻松地包装到 RegularGridInterpolator
中。以下是一个来自 Johanness Buchner 的“regulargrid”包 的简单示例。
class CartesianGridInterpolator:
def __init__(self, points, values, method='linear'):
self.limits = np.array([[min(x), max(x)] for x in points])
self.values = np.asarray(values, dtype=float)
self.order = {'linear': 1, 'cubic': 3, 'quintic': 5}[method]
def __call__(self, xi):
"""
`xi` here is an array-like (an array or a list) of points.
Each "point" is an ndim-dimensional array_like, representing
the coordinates of a point in ndim-dimensional space.
"""
# transpose the xi array into the ``map_coordinates`` convention
# which takes coordinates of a point along columns of a 2D array.
xi = np.asarray(xi).T
# convert from data coordinates to pixel coordinates
ns = self.values.shape
coords = [(n-1)*(val - lo) / (hi - lo)
for val, n, (lo, hi) in zip(xi, ns, self.limits)]
# interpolate
return map_coordinates(self.values, coords,
order=self.order,
cval=np.nan) # fill_value
此包装器可以用作 RegularGridInterpolator
的(几乎)直接替换。
>>> x, y = np.arange(5), np.arange(6)
>>> xx, yy = np.meshgrid(x, y, indexing='ij')
>>> values = xx**3 + yy**3
>>> rgi = RegularGridInterpolator((x, y), values, method='linear')
>>> rgi([[1.5, 1.5], [3.5, 2.6]])
array([ 9. , 64.9])
>>> cgi = CartesianGridInterpolator((x, y), values, method='linear')
array([ 9. , 64.9])
请注意,上面的示例使用 map_coordinates
边界条件。因此,cubic
和 quintic
插值的結果可能与 RegularGridInterpolator
的結果不同。有关边界条件和其他附加参数的更多详细信息,请参阅 scipy.ndimage.map_coordinates
文档。最后,我们注意到此简化示例假设输入数据按升序给出。